More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0702 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
297 aa  610  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  54.88 
 
 
313 aa  329  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  54.79 
 
 
300 aa  324  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  53.18 
 
 
300 aa  311  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  49.31 
 
 
289 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  49.48 
 
 
288 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  49.48 
 
 
287 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 
290 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  44.49 
 
 
287 aa  236  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  40.91 
 
 
289 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  40.91 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  42.12 
 
 
301 aa  226  3e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  42.81 
 
 
286 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  43.11 
 
 
287 aa  222  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  43.58 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  41.25 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  40.55 
 
 
297 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  40.88 
 
 
293 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  39.72 
 
 
283 aa  199  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  39.3 
 
 
291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  36.52 
 
 
304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 
288 aa  189  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  40.55 
 
 
291 aa  189  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  42.66 
 
 
307 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  41.61 
 
 
294 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  39.16 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  38.81 
 
 
288 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  37.1 
 
 
328 aa  176  6e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  38.7 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  38.49 
 
 
287 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  38.26 
 
 
293 aa  168  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 
308 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  38.01 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 
303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  35.06 
 
 
308 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  34.75 
 
 
311 aa  159  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  34.87 
 
 
306 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  35.33 
 
 
308 aa  159  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 
287 aa  159  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  35.93 
 
 
301 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
292 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  35.57 
 
 
304 aa  155  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 
270 aa  152  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  36.62 
 
 
284 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  36.62 
 
 
284 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  36.62 
 
 
284 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 
306 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.38 
 
 
293 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 
305 aa  149  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  36.26 
 
 
291 aa  148  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  34.24 
 
 
299 aa  148  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  34.7 
 
 
288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  36.54 
 
 
307 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5601  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 
303 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.988839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  33.23 
 
 
317 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  32.86 
 
 
296 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  32.86 
 
 
311 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  32.86 
 
 
311 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  32.85 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  32.85 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 
307 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  32.86 
 
 
349 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  33.11 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  32.85 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  32.85 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0982  alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 
308 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  32.44 
 
 
322 aa  139  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2042  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 
329 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0522  Alpha/beta hydrolase fold-1  41.53 
 
 
241 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  33.57 
 
 
273 aa  138  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
287 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
309 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  34.46 
 
 
307 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3189  alpha/beta hydrolase  33.9 
 
 
306 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  32.22 
 
 
323 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  31.87 
 
 
271 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  32.44 
 
 
308 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 
323 aa  136  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 
276 aa  136  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  31.46 
 
 
322 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  36.92 
 
 
283 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  35.38 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6199  alpha/beta hydrolase fold protein  32.87 
 
 
296 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82135  normal  0.298395 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 
343 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  30.43 
 
 
315 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  29.75 
 
 
334 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
331 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0770  alpha/beta hydrolase fold  32.57 
 
 
325 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 
315 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  31.52 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5124  alpha/beta hydrolase fold protein  35.97 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  30.1 
 
 
311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  27.45 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
312 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 
281 aa  129  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>