More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1770 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  100 
 
 		 311 aa  634    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  86.77 
 
 		 308 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  86.45 
 
 		 308 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  67.11 
 
 		 306 aa  434  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  66.78 
 
 		 306 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0982  alpha/beta hydrolase fold  44.84 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3189  alpha/beta hydrolase  44.52 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0770  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 		 325 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5601  alpha/beta hydrolase fold  41.95 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1129  alpha/beta hydrolase fold protein  42.52 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0708  alpha/beta hydrolase fold  45.51 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0688  alpha/beta hydrolase fold protein  44.09 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  40.69 
 
 		 290 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  35.24 
 
 		 309 aa  199  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  40.21 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 		 287 aa  198  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  38.91 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  38.14 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  39.37 
 
 		 304 aa  192  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  37.54 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  37.2 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  39.65 
 
 		 283 aa  189  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  41.64 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  38.49 
 
 		 284 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2042  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 329 aa  182  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  35.37 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  35.95 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  37.11 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  38.23 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  43.6 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  37.79 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  34.98 
 
 		 295 aa  165  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  35.92 
 
 		 328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 297 aa  159  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 291 aa  159  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  34.36 
 
 		 291 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  35.2 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  35.1 
 
 		 288 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  32.87 
 
 		 303 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  33.23 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.47 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 287 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6199  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82135  normal  0.298395 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  32.29 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  35.46 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  30.06 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  31.1 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 		 323 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  34.44 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 		 349 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5124  alpha/beta hydrolase fold protein  35.42 
 
 		 272 aa  115  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  31.16 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  31.16 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  31.16 
 
 		 349 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  31.83 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  31.5 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  31.5 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  31.5 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  31.5 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  47.06 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  30.96 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 		 305 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  32.87 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  44.2 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  31.14 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  44.29 
 
 		 307 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  27.1 
 
 		 322 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  27.73 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 305 aa  106  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.81 
 
 		 311 aa  105  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  40.35 
 
 		 310 aa  105  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  42.95 
 
 		 310 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>