More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3311 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 351 aa  692    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  36.47 
 
 		 322 aa  179  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  36.92 
 
 		 323 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  39.3 
 
 		 321 aa  176  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  34.99 
 
 		 312 aa  176  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  36.26 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 315 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 315 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  35.78 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  32.94 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  33.43 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  33.43 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  34.37 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  33.14 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  34.76 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  34.02 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  30.29 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  29.4 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  28.65 
 
 		 328 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.28 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 		 316 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  30.84 
 
 		 343 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  30.9 
 
 		 308 aa  99.4  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  45 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  41.48 
 
 		 301 aa  96.7  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 323 aa  95.1  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  41.98 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  41.04 
 
 		 293 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  40.71 
 
 		 284 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  39.2 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  44.55 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  44.55 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 390 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  42.48 
 
 		 308 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05183  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14860)  27.03 
 
 		 780 aa  90.5  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  44.55 
 
 		 304 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  37.84 
 
 		 290 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  43.8 
 
 		 287 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  43.36 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  41.74 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 		 331 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 		 287 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 		 301 aa  86.7  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  44.79 
 
 		 289 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  41.04 
 
 		 309 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  40.54 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6398  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.234405 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.16 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  40.3 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  39.67 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  41.96 
 
 		 494 aa  83.2  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  39.5 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  43.24 
 
 		 288 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9230  epoxide hydrolase  26.7 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.247355  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5525  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5889  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159226  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0418  alpha/beta hydrolase fold  39.83 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0502159  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  44.64 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  32.07 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  41.3 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  37.6 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  47.52 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  47.52 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  42.48 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  38.4 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  37.82 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7125  putative epoxide hydrolase  27.17 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.675745  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2842  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.36 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  41.59 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  35.4 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  38.05 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  39.23 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  38.05 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  38.05 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 310 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6641  hypothetical protein  49.33 
 
 		 144 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  40.74 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  38.6 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>