More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3168 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 305 aa  624  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  66.01 
 
 		 305 aa  431  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3248  EphC  41.5 
 
 		 300 aa  182  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  35.44 
 
 		 287 aa  179  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  38.69 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  37.93 
 
 		 287 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  37.99 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2990  alpha/beta hydrolase fold protein  36.21 
 
 		 322 aa  166  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  hitchhiker  0.00172435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11147  epoxide hydrolase ephC  35.27 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  34.27 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  31.62 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  32.87 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  33.82 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0191  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4086  alpha/beta hydrolase fold  34.56 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4162  alpha/beta hydrolase fold  34.56 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.573182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4316  alpha/beta hydrolase fold  34.56 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  33.1 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 304 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  31.96 
 
 		 290 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 296 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  32.75 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  33.46 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  36.42 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  36.7 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  31.74 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 287 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 		 299 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  31.38 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 288 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0714  alpha/beta hydrolase fold  34.97 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0301539  normal  0.0245198 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.82 
 
 		 293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  33.45 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  32.85 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  32.85 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  32.85 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  32.85 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  32.85 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  32.85 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  33.21 
 
 		 298 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  31.5 
 
 		 296 aa  128  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  31.72 
 
 		 301 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 323 aa  125  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  33.58 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  32.6 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  30.32 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  32.87 
 
 		 494 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  32.13 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 		 307 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 313 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 		 324 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  31.96 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 		 304 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  31.76 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.11 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  31.68 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  33.78 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 293 aa  112  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 		 356 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 307 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  28.48 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  28.31 
 
 		 322 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 		 310 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 315 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 		 293 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54746  soluble epoxide hydrolase  30.6 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38202  epoxide hydrolase, soluble (sEH)  29.75 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.927116  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  30.99 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>