More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0409 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
300 aa  605  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540254  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  45 
 
 
281 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  38.59 
 
 
305 aa  195  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  38.69 
 
 
305 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4316  alpha/beta hydrolase fold  36.88 
 
 
300 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4086  alpha/beta hydrolase fold  36.88 
 
 
300 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4162  alpha/beta hydrolase fold  36.88 
 
 
300 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.573182  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11147  epoxide hydrolase ephC  35.67 
 
 
316 aa  145  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 
287 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  30.64 
 
 
301 aa  139  7.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  36.11 
 
 
287 aa  132  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3248  EphC  35.81 
 
 
300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2990  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  hitchhiker  0.00172435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
284 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
284 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 
300 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0191  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  32.99 
 
 
328 aa  113  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 
301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  29.85 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  29.85 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  29.85 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  29.85 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  29.85 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  29.85 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 
293 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  29.85 
 
 
349 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 
297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  33.1 
 
 
296 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  26.56 
 
 
290 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  32.66 
 
 
296 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  29.5 
 
 
289 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  31.63 
 
 
302 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
286 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 
283 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 
298 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 
281 aa  106  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  32.32 
 
 
308 aa  106  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0714  alpha/beta hydrolase fold  29.94 
 
 
306 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0301539  normal  0.0245198 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 
296 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 
284 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
291 aa  105  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 
303 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 
288 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54746  soluble epoxide hydrolase  30.42 
 
 
321 aa  105  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38202  epoxide hydrolase, soluble (sEH)  29.76 
 
 
321 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.927116  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
291 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 
296 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  31.72 
 
 
296 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  32.98 
 
 
306 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
304 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 
277 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  32.29 
 
 
298 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 
274 aa  102  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  32.98 
 
 
298 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  32.29 
 
 
298 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  30.11 
 
 
296 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  32.29 
 
 
298 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  32.98 
 
 
298 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  32.98 
 
 
298 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  32.98 
 
 
298 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 
296 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  37.58 
 
 
304 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 
296 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 
296 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  31.29 
 
 
307 aa  99.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
287 aa  99  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 
288 aa  99  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  30.85 
 
 
281 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.53 
 
 
278 aa  98.6  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
287 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
308 aa  99  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 
300 aa  98.2  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  29.87 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  32.31 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  30.38 
 
 
310 aa  96.7  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 
289 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 
289 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
273 aa  95.9  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 
299 aa  95.9  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
349 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
308 aa  95.5  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 
288 aa  95.5  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
313 aa  93.2  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  31.83 
 
 
294 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 
307 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0688  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  26.73 
 
 
312 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  27.49 
 
 
322 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.73 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0708  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>