More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2677 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 315 aa  643    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  85.3 
 
 		 315 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  84.39 
 
 		 315 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  71.67 
 
 		 302 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  50.95 
 
 		 323 aa  292  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  47.91 
 
 		 317 aa  291  8e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  43.35 
 
 		 324 aa  277  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  48.89 
 
 		 323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  47.47 
 
 		 322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  43.81 
 
 		 323 aa  252  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  45.77 
 
 		 330 aa  249  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  44.73 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  44.73 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  44.73 
 
 		 341 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  39.94 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  41.91 
 
 		 308 aa  232  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  40.32 
 
 		 312 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  42.63 
 
 		 316 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 		 344 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.96 
 
 		 350 aa  209  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  37.81 
 
 		 323 aa  206  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  38.54 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  39.69 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  37.22 
 
 		 311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  35.52 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 		 331 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 315 aa  192  9e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  34.22 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  37.8 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  35.22 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  33.13 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 		 321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  34.98 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0276  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 434 aa  152  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2842  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 		 434 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5525  alpha/beta hydrolase fold  30.54 
 
 		 367 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5889  alpha/beta hydrolase fold  30.54 
 
 		 367 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159226  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6398  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 367 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.234405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 		 351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 390 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  31.55 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  30.13 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  30.13 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  32.49 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 287 aa  132  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  33.02 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  29.38 
 
 		 300 aa  125  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 		 284 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 		 304 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.99 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7125  putative epoxide hydrolase  30.03 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.675745  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  33.76 
 
 		 287 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  29.87 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  29.97 
 
 		 299 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  31.21 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 349 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  33.77 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  30.32 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  31.35 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  30.84 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  30.16 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  33.89 
 
 		 307 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  29.1 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  31.21 
 
 		 494 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  29.56 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  31.15 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  29.79 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 		 287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.12 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6110  alpha/beta hydrolase fold  45.74 
 
 		 376 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173305  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9230  epoxide hydrolase  44.19 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.247355  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  27.73 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5871  alpha/beta hydrolase fold  44.96 
 
 		 376 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4021  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 341 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.655043  normal  0.26756 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  29.36 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>