More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_54746 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_54746  soluble epoxide hydrolase  100 
 
 		 321 aa  665    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38202  epoxide hydrolase, soluble (sEH)  94.39 
 
 		 321 aa  615  1e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.927116  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 305 aa  116  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 281 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11147  epoxide hydrolase ephC  28.87 
 
 		 316 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  25.48 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4086  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4316  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4162  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.573182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 		 287 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0714  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 306 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0301539  normal  0.0245198 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3248  EphC  24.05 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2990  alpha/beta hydrolase fold protein  23.51 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  hitchhiker  0.00172435 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0191  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  23.83 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  23.83 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  26.6 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  23.74 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  23.81 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  23.81 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  23.81 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  26.58 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  23.81 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  24.76 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  24.76 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  23.81 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  23.81 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  23.81 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  24.15 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  25.26 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  24.73 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  23.84 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  23.34 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 273 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  26.01 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  24.01 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  22.11 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  23.08 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3859  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1047  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 275 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  21.55 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4764  alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  23.1 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  23.68 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  23.68 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  23.51 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  25.73 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  25.9 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  25.72 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  23.59 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  23.47 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  24.09 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  24.68 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  24.76 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.82 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  22.41 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  23.97 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  23.65 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1129  alpha/beta hydrolase fold protein  23.99 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  23.29 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  22.34 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  22.38 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  22.81 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  21.88 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  24.56 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  23.02 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>