More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2990 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2990  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 322 aa  656    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  hitchhiker  0.00172435 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3248  EphC  54.14 
 
 		 300 aa  287  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  47.42 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  38.91 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 		 287 aa  169  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11147  epoxide hydrolase ephC  33.68 
 
 		 316 aa  155  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4316  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 		 300 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4086  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 		 300 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4162  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 		 300 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.573182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  32.07 
 
 		 281 aa  123  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0714  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0301539  normal  0.0245198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0191  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  32.18 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  33.79 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  33.79 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  30.09 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 		 289 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  34.31 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  30.27 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  29.65 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 287 aa  99.4  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 313 aa  99.4  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  30.64 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 		 297 aa  99  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  31.06 
 
 		 296 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  30.16 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.03 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 288 aa  95.9  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  29.51 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 349 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 293 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  28.66 
 
 		 337 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  30.03 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  25.98 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  27.13 
 
 		 322 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.13 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  31.63 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 288 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  24.92 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  30.26 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 		 323 aa  86.3  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 		 303 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  30.93 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  30.21 
 
 		 494 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  29.56 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.66 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0982  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 		 310 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 		 270 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 		 288 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9230  epoxide hydrolase  43.51 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.247355  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  25.26 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  30.61 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  30.61 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  30.61 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  30.27 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  30.27 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3859  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  30.27 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  30.27 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  28.42 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>