More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2401 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 296 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  95.95 
 
 		 296 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  88.85 
 
 		 296 aa  524  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  88.85 
 
 		 296 aa  524  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  89.15 
 
 		 296 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  85.42 
 
 		 296 aa  518  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  88.05 
 
 		 294 aa  518  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  77.21 
 
 		 298 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  77.21 
 
 		 298 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  77.21 
 
 		 298 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  77.21 
 
 		 298 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  77.82 
 
 		 298 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  77.21 
 
 		 298 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  77.21 
 
 		 298 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  77.74 
 
 		 306 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  72.64 
 
 		 296 aa  435  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  69.59 
 
 		 296 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  48.11 
 
 		 298 aa  279  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  52.41 
 
 		 302 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  40.99 
 
 		 310 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  40.99 
 
 		 310 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  40.34 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  44.88 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  40.14 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  38.31 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  39.3 
 
 		 350 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  38.87 
 
 		 346 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  40.2 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  38.59 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  38.54 
 
 		 352 aa  185  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  38.87 
 
 		 350 aa  185  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  38.18 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  36.62 
 
 		 337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 		 336 aa  183  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 		 343 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  40.14 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 344 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  38.16 
 
 		 350 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  36.75 
 
 		 349 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  36.99 
 
 		 347 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 		 354 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  36.88 
 
 		 350 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 		 346 aa  175  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 		 347 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 		 347 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  36.93 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 		 345 aa  172  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  38.6 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  35.92 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  37.41 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  36.93 
 
 		 348 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  35.53 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  38.31 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  35.44 
 
 		 340 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 		 347 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  33.1 
 
 		 347 aa  163  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  36.62 
 
 		 341 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 		 349 aa  162  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 		 354 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 		 346 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  34.04 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  35.21 
 
 		 346 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  36.81 
 
 		 356 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  36.97 
 
 		 456 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  36.97 
 
 		 453 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  36.97 
 
 		 444 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 305 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1116  alpha/beta hydrolase  63.37 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.500827  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11147  epoxide hydrolase ephC  29.19 
 
 		 316 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  29.5 
 
 		 307 aa  89.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  31.72 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3248  EphC  32.09 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4316  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4086  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0191  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4162  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.573182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2990  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  hitchhiker  0.00172435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  28.34 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  28.26 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  28.48 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>