More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4707 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 293 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  40.96 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  39.93 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  39.37 
 
 		 296 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  39.51 
 
 		 296 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  36.24 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  37.2 
 
 		 305 aa  205  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  37.72 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  37.32 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  37.32 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  37.32 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  37.32 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  37.46 
 
 		 298 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  37.32 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  36.97 
 
 		 298 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  38.46 
 
 		 294 aa  198  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  36.97 
 
 		 298 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  38.41 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  35.84 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  35.84 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 		 346 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  33.9 
 
 		 364 aa  182  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  35.21 
 
 		 350 aa  182  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 343 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 343 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  33.79 
 
 		 350 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  35.31 
 
 		 304 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  34.63 
 
 		 340 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 341 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  33.79 
 
 		 348 aa  175  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  34.62 
 
 		 347 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 354 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  35.25 
 
 		 307 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  34.67 
 
 		 341 aa  168  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  34.28 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  33.8 
 
 		 352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 346 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  32.86 
 
 		 345 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 		 337 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  31.38 
 
 		 347 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 296 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  34.97 
 
 		 456 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  32.18 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 350 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  32.07 
 
 		 347 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  33.69 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  34.62 
 
 		 453 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  34.62 
 
 		 444 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 		 346 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 		 346 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 347 aa  153  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  32.17 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 		 341 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  30.41 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  31.65 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 		 294 aa  99  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 294 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 291 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 291 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 337 aa  87  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  26.19 
 
 		 303 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  27.08 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  27.08 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  27.08 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  31.6 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  25.66 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11147  epoxide hydrolase ephC  24.91 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  25.34 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  24.33 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>