More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1437 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 305 aa  623  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  55.56 
 
 		 299 aa  323  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  58.25 
 
 		 296 aa  319  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  56.21 
 
 		 305 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  54.92 
 
 		 305 aa  309  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  55.12 
 
 		 307 aa  297  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  54.7 
 
 		 293 aa  295  8e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  52.36 
 
 		 304 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  51.4 
 
 		 308 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  54.93 
 
 		 308 aa  285  5.999999999999999e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  48.99 
 
 		 345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  48.41 
 
 		 350 aa  275  6e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  46.62 
 
 		 347 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  44.48 
 
 		 347 aa  273  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  46.1 
 
 		 337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  44.26 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  46.44 
 
 		 343 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  46.44 
 
 		 341 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  45.76 
 
 		 346 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  46.1 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  45.42 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  47.52 
 
 		 336 aa  266  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  45.42 
 
 		 349 aa  265  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  46.1 
 
 		 347 aa  265  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  46.78 
 
 		 354 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  45.08 
 
 		 348 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  45.76 
 
 		 352 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  44.9 
 
 		 347 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  47 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  45.76 
 
 		 350 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  45.21 
 
 		 345 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  45.7 
 
 		 347 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  45.7 
 
 		 347 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  44.75 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  45.74 
 
 		 341 aa  255  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  47.14 
 
 		 349 aa  255  8e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  44.9 
 
 		 347 aa  254  9e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  44.75 
 
 		 350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  45.23 
 
 		 346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  44.67 
 
 		 346 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  43.73 
 
 		 346 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  45.24 
 
 		 347 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  42.57 
 
 		 364 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  50.18 
 
 		 356 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  43.73 
 
 		 348 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  43.39 
 
 		 341 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  42.91 
 
 		 347 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  43.39 
 
 		 456 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  41.69 
 
 		 350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  43.73 
 
 		 453 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  43.73 
 
 		 444 aa  242  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  38.62 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  38.62 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  42.03 
 
 		 296 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  40.2 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  40.88 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  40.2 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  38.75 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  39.52 
 
 		 296 aa  188  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  40 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  41.55 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  40 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  40 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  40 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  39.66 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  39.66 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  39.66 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  39.86 
 
 		 296 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  40.2 
 
 		 296 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  40.2 
 
 		 296 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  37.25 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  38.75 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  26.78 
 
 		 287 aa  92.4  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  32.59 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3248  EphC  28.22 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11147  epoxide hydrolase ephC  27.59 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.78 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  25.75 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  29.05 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0191  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3108  alpha/beta hydrolase fold protein  39.81 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962894  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4086  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4162  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.573182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4316  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  22.73 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  37.96 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  35.65 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>