More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2941 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  99.77 
 
 
453 aa  892    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  97.42 
 
 
456 aa  760    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
444 aa  894    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  91.14 
 
 
347 aa  624  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  79.14 
 
 
347 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  76.57 
 
 
343 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  76.57 
 
 
343 aa  561  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  76.29 
 
 
347 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  75.71 
 
 
347 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  79.14 
 
 
347 aa  535  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  75.71 
 
 
346 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  75.43 
 
 
346 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  72 
 
 
341 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  73.71 
 
 
347 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  66.76 
 
 
344 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  70.48 
 
 
349 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  67.43 
 
 
348 aa  481  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  65.32 
 
 
349 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  63.14 
 
 
337 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  64.84 
 
 
350 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  64.08 
 
 
350 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  65.34 
 
 
350 aa  456  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  65.03 
 
 
354 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  63.69 
 
 
352 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  66.38 
 
 
347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  63.2 
 
 
341 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  70.59 
 
 
340 aa  445  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  62.61 
 
 
350 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  64.78 
 
 
346 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  61.89 
 
 
347 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  65.91 
 
 
341 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  64.74 
 
 
348 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  68.51 
 
 
346 aa  425  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  69.23 
 
 
345 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  59.77 
 
 
354 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  60.69 
 
 
347 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  65.42 
 
 
345 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  64.75 
 
 
347 aa  402  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  61.46 
 
 
336 aa  359  5e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  57.98 
 
 
364 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  56.33 
 
 
308 aa  333  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  53.4 
 
 
307 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  54.64 
 
 
356 aa  303  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  52.74 
 
 
305 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  54.14 
 
 
296 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  52.41 
 
 
305 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  52.76 
 
 
293 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  51.37 
 
 
304 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
308 aa  263  4.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  48.23 
 
 
299 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  43.73 
 
 
305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  39.8 
 
 
302 aa  204  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  38.7 
 
 
296 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  39.22 
 
 
298 aa  182  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 
310 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 
310 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  37.23 
 
 
296 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  37.46 
 
 
306 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  36.17 
 
 
298 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  36.52 
 
 
298 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  38.65 
 
 
296 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  37.81 
 
 
296 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  36.17 
 
 
298 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  36.17 
 
 
298 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  36.52 
 
 
298 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  36.17 
 
 
298 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  36.17 
 
 
298 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 
296 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 
296 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 
296 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
293 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  38.3 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  36.4 
 
 
296 aa  163  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 
305 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
287 aa  87.4  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  33.53 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  31.02 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  30.73 
 
 
291 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  31.79 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
308 aa  73.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  34.9 
 
 
356 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 
264 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1116  alpha/beta hydrolase  40.66 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.500827  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  38.52 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  37.09 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4764  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  31.06 
 
 
326 aa  69.3  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  38.93 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>