More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2052 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  93.41 
 
 
349 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
344 aa  707    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  71.88 
 
 
343 aa  524  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  71.88 
 
 
343 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  72.41 
 
 
348 aa  521  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  71.23 
 
 
352 aa  521  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  70.57 
 
 
350 aa  508  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  68.97 
 
 
350 aa  494  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  68.59 
 
 
350 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  70.06 
 
 
341 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  68.02 
 
 
347 aa  488  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  67.15 
 
 
337 aa  489  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  67.72 
 
 
347 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  65.89 
 
 
354 aa  474  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  64.84 
 
 
347 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  69.35 
 
 
340 aa  472  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  67.83 
 
 
348 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  64.84 
 
 
347 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  64.55 
 
 
347 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  66.57 
 
 
345 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  66.87 
 
 
349 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  66.57 
 
 
341 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  66.96 
 
 
453 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  66.76 
 
 
456 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  66.96 
 
 
444 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  66.16 
 
 
341 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  65.77 
 
 
346 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  64.24 
 
 
350 aa  457  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  64.86 
 
 
345 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  66.07 
 
 
346 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  64.52 
 
 
347 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  64.74 
 
 
346 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  64.45 
 
 
346 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  62 
 
 
354 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  63.2 
 
 
347 aa  441  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  64.84 
 
 
347 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  64.55 
 
 
347 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  61.71 
 
 
347 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  60.25 
 
 
364 aa  391  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  60.07 
 
 
336 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  57.91 
 
 
308 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  54.24 
 
 
307 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  55.1 
 
 
356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  50.68 
 
 
305 aa  286  4e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  52.56 
 
 
305 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  54.14 
 
 
296 aa  285  8e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
293 aa  278  8e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  51.19 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  45.42 
 
 
305 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  47.59 
 
 
308 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  44.9 
 
 
299 aa  256  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  40.82 
 
 
302 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 
298 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  36.93 
 
 
296 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  38.73 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  37.46 
 
 
298 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 
310 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 
310 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  37.46 
 
 
298 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  37.46 
 
 
298 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  37.46 
 
 
298 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  37.46 
 
 
298 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  38.16 
 
 
296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  37.1 
 
 
298 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  37.32 
 
 
306 aa  182  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  37.1 
 
 
298 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 
293 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 
296 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 
296 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  38.16 
 
 
296 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  36.75 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  37.81 
 
 
296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  37.81 
 
 
296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
308 aa  99  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 
308 aa  90.1  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
287 aa  89.4  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  31.96 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
305 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 
301 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  29.05 
 
 
494 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  34.87 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  37.96 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  35.67 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  36.57 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  36.91 
 
 
356 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 
315 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 
315 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  31.55 
 
 
356 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  38.76 
 
 
323 aa  77  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  42.74 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>