More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5036 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
341 aa  697    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  84.26 
 
 
343 aa  607  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  83.38 
 
 
343 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  72.91 
 
 
347 aa  531  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  72.97 
 
 
347 aa  522  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  71.51 
 
 
347 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  70.06 
 
 
344 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  71.51 
 
 
347 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  72.29 
 
 
456 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  72 
 
 
444 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  72 
 
 
453 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  68.77 
 
 
349 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  67.74 
 
 
337 aa  494  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  65.8 
 
 
348 aa  485  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  66.29 
 
 
350 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  69.94 
 
 
346 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  70.61 
 
 
347 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  70.23 
 
 
346 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  63.53 
 
 
352 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  71.18 
 
 
347 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  68.1 
 
 
349 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  64.57 
 
 
350 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  67.47 
 
 
340 aa  464  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  64.39 
 
 
350 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  62.54 
 
 
350 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  64.84 
 
 
347 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  65.38 
 
 
354 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  63.53 
 
 
346 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  64.42 
 
 
341 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  63.95 
 
 
348 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  64.04 
 
 
347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  62.5 
 
 
341 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  62.91 
 
 
347 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  59.14 
 
 
354 aa  437  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  63.42 
 
 
346 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  62.28 
 
 
345 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  59.06 
 
 
345 aa  425  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  63.32 
 
 
347 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  60.41 
 
 
336 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  56.77 
 
 
364 aa  352  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  53.44 
 
 
308 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  52.05 
 
 
307 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  52.88 
 
 
356 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  51.71 
 
 
305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  52.56 
 
 
304 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  51.2 
 
 
308 aa  276  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  49.31 
 
 
293 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  51.38 
 
 
296 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  44.93 
 
 
299 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  43.39 
 
 
305 aa  255  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  40.34 
 
 
302 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  34.64 
 
 
310 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  34.64 
 
 
310 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  37.23 
 
 
298 aa  179  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  35.94 
 
 
298 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  35.94 
 
 
298 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  35.94 
 
 
298 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  35.94 
 
 
298 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  35.94 
 
 
298 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  35.94 
 
 
298 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  35.94 
 
 
298 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  35.19 
 
 
296 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  36.17 
 
 
306 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 
296 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  36.62 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 
296 aa  172  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  37.32 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
296 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
296 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 
293 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  33.45 
 
 
296 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
287 aa  92.8  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  32.6 
 
 
287 aa  89.4  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4764  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
300 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
308 aa  86.7  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  40.74 
 
 
334 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  35.07 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  29.38 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  26.58 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  38.06 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  34.23 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  27.13 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  37.72 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>