More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4231 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 364 aa  738    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  55.01 
 
 		 344 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  58.09 
 
 		 348 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  61.13 
 
 		 350 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  60.57 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  57.35 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  61.79 
 
 		 346 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  55.92 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  56.08 
 
 		 350 aa  371  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  54.93 
 
 		 350 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  59.41 
 
 		 343 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  53.95 
 
 		 350 aa  368  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  55.56 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  59.27 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  54.33 
 
 		 347 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  55.16 
 
 		 349 aa  362  8e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  56.33 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  57.76 
 
 		 345 aa  359  4e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  53.24 
 
 		 346 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  50.97 
 
 		 347 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  57 
 
 		 347 aa  358  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  58 
 
 		 347 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  52.94 
 
 		 346 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  57.43 
 
 		 347 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  57.96 
 
 		 340 aa  356  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  55.7 
 
 		 337 aa  355  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  50.95 
 
 		 346 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  58.14 
 
 		 347 aa  349  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  56.31 
 
 		 347 aa  349  4e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  57.62 
 
 		 347 aa  349  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  55.85 
 
 		 348 aa  347  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  52.77 
 
 		 345 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  58.16 
 
 		 341 aa  345  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  58.03 
 
 		 347 aa  342  7e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  56.77 
 
 		 341 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  57.98 
 
 		 456 aa  335  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  55.82 
 
 		 336 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  57.98 
 
 		 453 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  57.98 
 
 		 444 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  50.61 
 
 		 341 aa  329  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  53.47 
 
 		 308 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  50.68 
 
 		 307 aa  289  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  47.83 
 
 		 305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  47.8 
 
 		 293 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  49.14 
 
 		 296 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  48.29 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  49.32 
 
 		 304 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  46.6 
 
 		 305 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  45.79 
 
 		 308 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  42.57 
 
 		 305 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  43.73 
 
 		 299 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  40.27 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  35.99 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  35.99 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  38.87 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 293 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  36.46 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  36.27 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  36.27 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 		 296 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  35.69 
 
 		 296 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  35.56 
 
 		 306 aa  169  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  35.92 
 
 		 298 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  35.92 
 
 		 298 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  35.92 
 
 		 298 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  35.92 
 
 		 298 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  35.92 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 296 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 		 296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 		 296 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 		 296 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  35.69 
 
 		 294 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 308 aa  86.3  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  28.66 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  27.67 
 
 		 301 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  32.37 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  35.54 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.71 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  25.77 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 		 294 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 323 aa  69.3  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  36.64 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>