More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2276 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  93.41 
 
 
344 aa  669    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
349 aa  717    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  72.78 
 
 
348 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  71.79 
 
 
352 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  70.57 
 
 
343 aa  521  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  69.91 
 
 
343 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  70.29 
 
 
350 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  69.25 
 
 
350 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  68.01 
 
 
350 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  68.77 
 
 
341 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  65.62 
 
 
337 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  69.36 
 
 
348 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  67.65 
 
 
347 aa  480  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  65.9 
 
 
347 aa  478  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  65.9 
 
 
354 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  67.77 
 
 
349 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  68.24 
 
 
340 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  63.32 
 
 
347 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  63.04 
 
 
347 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  62.75 
 
 
347 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  65.62 
 
 
341 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  65.51 
 
 
453 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  64.97 
 
 
341 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  65.51 
 
 
456 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  65.51 
 
 
444 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  64.22 
 
 
346 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  63.82 
 
 
345 aa  449  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  62.82 
 
 
350 aa  449  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  64.5 
 
 
345 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  65.98 
 
 
346 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  61.43 
 
 
354 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  63.9 
 
 
347 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  63.61 
 
 
346 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  63.01 
 
 
347 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  62.28 
 
 
347 aa  436  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  63.32 
 
 
346 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  62.75 
 
 
347 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  60.39 
 
 
347 aa  388  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  60.57 
 
 
364 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  59.73 
 
 
336 aa  364  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  57.91 
 
 
308 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  53.9 
 
 
307 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  53.4 
 
 
356 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  54.14 
 
 
296 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
305 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  51.88 
 
 
305 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  49.66 
 
 
293 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  50.85 
 
 
304 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  45.42 
 
 
305 aa  266  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  46.55 
 
 
308 aa  252  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  44.56 
 
 
299 aa  248  9e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  40.82 
 
 
302 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  40.14 
 
 
296 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  38.19 
 
 
296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  38.16 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  38.16 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  38.16 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  38.16 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  38.03 
 
 
306 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  38.16 
 
 
298 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  37.81 
 
 
298 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  37.81 
 
 
298 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  34.32 
 
 
310 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  34.32 
 
 
310 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  37.81 
 
 
296 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  37.81 
 
 
296 aa  179  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  38.95 
 
 
298 aa  179  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 
296 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 
293 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 
296 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  39.22 
 
 
296 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  39.22 
 
 
296 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  38.16 
 
 
294 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
305 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
308 aa  91.7  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 
287 aa  82  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  30.19 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 
278 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  25.39 
 
 
314 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  34.67 
 
 
351 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  35.57 
 
 
356 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  37.23 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 
307 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 
305 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  31.35 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  33.33 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  35.44 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  40.54 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  39.32 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  41.94 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 
270 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>