More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0723 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
270 aa  545  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  48.12 
 
 
349 aa  222  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  44.74 
 
 
308 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  43.98 
 
 
308 aa  202  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1377  alpha/beta hydrolase fold  43.08 
 
 
319 aa  202  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.2117  normal  0.107315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5429  alpha/beta hydrolase fold  44.32 
 
 
319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5199  alpha/beta hydrolase fold  43.97 
 
 
317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  hitchhiker  0.000578485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13701  epoxide hydrolase ephE  42.28 
 
 
327 aa  200  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0688152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4812  alpha/beta hydrolase fold  43.36 
 
 
317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4898  alpha/beta hydrolase fold  43.36 
 
 
317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451029  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  42.75 
 
 
313 aa  198  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  43.51 
 
 
304 aa  198  9e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  39.92 
 
 
322 aa  194  9e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  43.35 
 
 
494 aa  192  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  40.68 
 
 
308 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  41.95 
 
 
301 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  40.68 
 
 
311 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  40.93 
 
 
307 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  40.3 
 
 
311 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0418  alpha/beta hydrolase fold  44.91 
 
 
305 aa  182  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0502159  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  40.23 
 
 
310 aa  182  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
307 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  40.15 
 
 
308 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  38.72 
 
 
310 aa  172  7.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  42.37 
 
 
298 aa  168  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.681258  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  36.86 
 
 
299 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  39.92 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  40.08 
 
 
310 aa  159  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
287 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0438  alpha/beta hydrolase fold protein  33.72 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  37.16 
 
 
286 aa  125  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  34.83 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  32.97 
 
 
303 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 
287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.31 
 
 
308 aa  112  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  32.36 
 
 
301 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 
283 aa  109  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
300 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  44.52 
 
 
270 aa  107  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
305 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  32.2 
 
 
289 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 
307 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  36.5 
 
 
294 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
287 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
287 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
337 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  32.34 
 
 
297 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  31.41 
 
 
308 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  50.51 
 
 
350 aa  99  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  29.87 
 
 
323 aa  99  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
287 aa  98.6  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
313 aa  97.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  39.75 
 
 
323 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 
328 aa  96.3  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
288 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  43.33 
 
 
323 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  40.38 
 
 
324 aa  95.9  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
323 aa  94.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  34.32 
 
 
287 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 
288 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 
312 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 
317 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
341 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 
300 aa  94  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 
304 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  34.32 
 
 
293 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
292 aa  92.8  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
291 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
291 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
315 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
315 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 
308 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  31.66 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  42.31 
 
 
302 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  31.87 
 
 
281 aa  90.1  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 
330 aa  89.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
306 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  28.52 
 
 
322 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  43.52 
 
 
323 aa  89.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 
287 aa  89  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  35.53 
 
 
291 aa  89  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 
291 aa  88.6  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.37 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
345 aa  87.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  46.53 
 
 
344 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  48 
 
 
356 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
306 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  39.67 
 
 
334 aa  85.9  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>