More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1837 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 299 aa  617  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  65.87 
 
 		 305 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  60.07 
 
 		 293 aa  347  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  60.27 
 
 		 296 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  55.56 
 
 		 305 aa  323  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  56.51 
 
 		 305 aa  319  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  54.88 
 
 		 304 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  56.06 
 
 		 307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  54.04 
 
 		 308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  50.17 
 
 		 340 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  49.31 
 
 		 350 aa  277  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  48.61 
 
 		 336 aa  276  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  51.1 
 
 		 341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  47.08 
 
 		 354 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  48.59 
 
 		 347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  45.27 
 
 		 354 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  48.24 
 
 		 347 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  48.59 
 
 		 347 aa  268  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  48.94 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  46.74 
 
 		 346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  48.25 
 
 		 347 aa  265  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  47.74 
 
 		 341 aa  265  8e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  44.01 
 
 		 347 aa  265  8e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  46.44 
 
 		 345 aa  264  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  46.15 
 
 		 350 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  47.04 
 
 		 343 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  50.53 
 
 		 356 aa  262  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  47.04 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  49.65 
 
 		 347 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  45.95 
 
 		 347 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  48.24 
 
 		 345 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  48.24 
 
 		 346 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  44.78 
 
 		 352 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  47.89 
 
 		 346 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  48.41 
 
 		 349 aa  258  8e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  48.59 
 
 		 347 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  48.1 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  44.9 
 
 		 344 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  45.24 
 
 		 346 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  46.13 
 
 		 350 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  47.04 
 
 		 347 aa  255  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  46.85 
 
 		 348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  46.76 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  43.73 
 
 		 364 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  44.64 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  44.6 
 
 		 347 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  44.56 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  44.93 
 
 		 341 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  48.23 
 
 		 456 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  48.23 
 
 		 453 aa  241  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  48.23 
 
 		 444 aa  241  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  43.1 
 
 		 302 aa  222  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  39.31 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  39.31 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  41.38 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  40.34 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  41.67 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  41.81 
 
 		 296 aa  208  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  41.32 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  41.32 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  41.32 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  40.97 
 
 		 298 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  40.97 
 
 		 298 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  40.97 
 
 		 298 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  40.97 
 
 		 298 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  42.71 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  42.01 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  39.79 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  38.89 
 
 		 296 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 287 aa  125  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  30.2 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  37.96 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  33.81 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  34.84 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  25.15 
 
 		 323 aa  86.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 		 308 aa  85.9  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 291 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  36.76 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  25.34 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  41.32 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  35.97 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  37.7 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3248  EphC  32.55 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  44.34 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>