More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6836 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 345 aa  707    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  74.35 
 
 		 346 aa  545  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  65.79 
 
 		 352 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  70.53 
 
 		 350 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  66.46 
 
 		 350 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  64.39 
 
 		 349 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  64.86 
 
 		 341 aa  451  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  73.45 
 
 		 340 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  64.86 
 
 		 344 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  70.17 
 
 		 349 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  61.34 
 
 		 337 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  69.31 
 
 		 343 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  61.49 
 
 		 347 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  69.31 
 
 		 343 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  69.07 
 
 		 348 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  63.03 
 
 		 341 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  62.46 
 
 		 348 aa  428  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  59.09 
 
 		 354 aa  428  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  69.55 
 
 		 347 aa  428  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  69.44 
 
 		 347 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  67.59 
 
 		 347 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  67.59 
 
 		 347 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  68.62 
 
 		 341 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  62.31 
 
 		 350 aa  421  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  64.08 
 
 		 347 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  57.88 
 
 		 347 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  67.01 
 
 		 346 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  57.59 
 
 		 354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  64.83 
 
 		 350 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  69.23 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  69.23 
 
 		 444 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  57.53 
 
 		 345 aa  403  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  69.07 
 
 		 347 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  69.23 
 
 		 456 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  62.31 
 
 		 346 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  62.01 
 
 		 346 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  66.1 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  59.79 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  60.34 
 
 		 336 aa  363  3e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  57 
 
 		 364 aa  345  8.999999999999999e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  53.95 
 
 		 308 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  53.26 
 
 		 307 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  51.86 
 
 		 305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  50.33 
 
 		 356 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  50.17 
 
 		 304 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  48.97 
 
 		 305 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 293 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  48.24 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  45.21 
 
 		 305 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  49.31 
 
 		 296 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  47.22 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  37.97 
 
 		 302 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  38.16 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  33.93 
 
 		 296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  35.23 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  35.23 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  35.23 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  35.23 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  35.23 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  35.23 
 
 		 298 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 		 296 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  35.23 
 
 		 298 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  35 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 		 296 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  34.88 
 
 		 296 aa  155  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  36.3 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 		 296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 		 296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 		 296 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 		 305 aa  85.9  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4764  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  28.37 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  28.37 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  28.37 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  36.51 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  33.55 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  31.11 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  37.19 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 301 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  29.19 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  35.9 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>