More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0364 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  99.67 
 
 
304 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  100 
 
 
304 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  100 
 
 
304 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  61.64 
 
 
295 aa  378  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  61.22 
 
 
297 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  58.56 
 
 
294 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  52.94 
 
 
291 aa  300  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  51.26 
 
 
294 aa  295  7e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  48.18 
 
 
290 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  47.81 
 
 
290 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  48.19 
 
 
294 aa  287  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  50.72 
 
 
291 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  49.31 
 
 
291 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  49.48 
 
 
303 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  48.93 
 
 
292 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  48.1 
 
 
293 aa  277  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  48.6 
 
 
298 aa  276  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  53.38 
 
 
290 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  49.82 
 
 
292 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  47.86 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  47.26 
 
 
323 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  51.09 
 
 
303 aa  271  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  48.53 
 
 
296 aa  268  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  47.28 
 
 
298 aa  267  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  45.21 
 
 
300 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  48.71 
 
 
316 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  49.08 
 
 
316 aa  264  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  49.1 
 
 
304 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  48.71 
 
 
297 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  48.71 
 
 
297 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  49.08 
 
 
299 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  47.97 
 
 
298 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  47.97 
 
 
298 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  48.01 
 
 
292 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  47.48 
 
 
308 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  47.97 
 
 
298 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  45.55 
 
 
312 aa  258  8e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  49.43 
 
 
308 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  45.96 
 
 
296 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  47.6 
 
 
298 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  45.42 
 
 
297 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  49.05 
 
 
308 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  50.2 
 
 
299 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  48.34 
 
 
298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  48.68 
 
 
298 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  49.06 
 
 
298 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  46.69 
 
 
309 aa  245  6.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  44.15 
 
 
301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  44.64 
 
 
295 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  44.37 
 
 
297 aa  225  9e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  39.59 
 
 
301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  39.59 
 
 
301 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  40.96 
 
 
301 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  42.46 
 
 
317 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  44.09 
 
 
278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 
302 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  42.76 
 
 
294 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  41.89 
 
 
292 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  58.86 
 
 
194 aa  202  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  39.66 
 
 
300 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  39.73 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  40.36 
 
 
291 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  40.36 
 
 
291 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  42.14 
 
 
301 aa  195  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  39.66 
 
 
289 aa  195  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3595  alpha/beta hydrolase fold  37.76 
 
 
311 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  40.7 
 
 
292 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  39.78 
 
 
291 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  39.78 
 
 
291 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  40.27 
 
 
301 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  39.8 
 
 
294 aa  192  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  39.78 
 
 
291 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  38.98 
 
 
321 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  37.14 
 
 
313 aa  189  7e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  38.49 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  40.07 
 
 
286 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  38.51 
 
 
305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  39.32 
 
 
292 aa  178  8e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  40.62 
 
 
288 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  36.2 
 
 
288 aa  175  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 
287 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  35.4 
 
 
287 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  38.44 
 
 
292 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  35.15 
 
 
336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  37.76 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  36.24 
 
 
305 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  35.91 
 
 
305 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  47.71 
 
 
236 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  34.89 
 
 
351 aa  116  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  33.48 
 
 
291 aa  112  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 
283 aa  112  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 
262 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  30.64 
 
 
317 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 
294 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
294 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.53 
 
 
341 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0113  putative hydrolase protein  30.15 
 
 
267 aa  107  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal  0.0574017 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
291 aa  105  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 
321 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>