More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4288 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 262 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  39.54 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  39.54 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  39.54 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  37.79 
 
 		 306 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  37.79 
 
 		 306 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  40.56 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  37.69 
 
 		 320 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  39.53 
 
 		 294 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 		 297 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  38.91 
 
 		 309 aa  171  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  36.92 
 
 		 335 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  36.05 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.31 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  35.38 
 
 		 278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 		 291 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 291 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  34.77 
 
 		 324 aa  159  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  37.64 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  36.94 
 
 		 335 aa  158  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  36.02 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  35.82 
 
 		 348 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  34.83 
 
 		 340 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  34.22 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  34.11 
 
 		 346 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  32.82 
 
 		 302 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 		 306 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 		 351 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 		 302 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  35.88 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  30.8 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 		 289 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 		 289 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 287 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 297 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  32.44 
 
 		 317 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  31.95 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  31.95 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 		 291 aa  128  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 		 311 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 		 297 aa  118  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  31.23 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 300 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 		 278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 294 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  29.81 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  29.32 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  29.81 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  29.81 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 291 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  28.95 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  28.95 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  28.95 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 284 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  29.32 
 
 		 298 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8637  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 		 370 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  28.36 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 291 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  27.82 
 
 		 323 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 301 aa  99.4  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>