More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0433 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  94.59 
 
 
323 aa  573  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  82.03 
 
 
296 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  79.52 
 
 
298 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  79.52 
 
 
298 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  79.18 
 
 
298 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  78.31 
 
 
316 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  78.98 
 
 
316 aa  485  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  78.31 
 
 
297 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  78.31 
 
 
297 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  77.63 
 
 
298 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  79.18 
 
 
298 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  76.74 
 
 
298 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  76.39 
 
 
298 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  64.26 
 
 
299 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  66.78 
 
 
308 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  62.89 
 
 
293 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  62.54 
 
 
292 aa  364  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  63.32 
 
 
308 aa  363  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  62.98 
 
 
308 aa  361  8e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  61.99 
 
 
299 aa  359  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  60.82 
 
 
304 aa  354  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  59.17 
 
 
291 aa  346  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  57.04 
 
 
292 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  59.01 
 
 
300 aa  332  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  56.9 
 
 
292 aa  329  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  57.04 
 
 
297 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  52.03 
 
 
312 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  58.82 
 
 
290 aa  309  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  50.34 
 
 
290 aa  308  9e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  53.18 
 
 
309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 
290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  54.98 
 
 
291 aa  305  6e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  52.6 
 
 
291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  54.83 
 
 
292 aa  300  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  52.94 
 
 
295 aa  295  6e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  53.45 
 
 
303 aa  291  6e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  50.17 
 
 
301 aa  289  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  50.52 
 
 
294 aa  288  6e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  48.12 
 
 
294 aa  286  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  51.05 
 
 
297 aa  285  7e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  51.04 
 
 
298 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  48.53 
 
 
304 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  48.53 
 
 
304 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  48.16 
 
 
304 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  46.39 
 
 
301 aa  265  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  52.71 
 
 
294 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  44.71 
 
 
302 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  46.39 
 
 
298 aa  263  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  46.99 
 
 
303 aa  263  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  45.02 
 
 
301 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  44.03 
 
 
301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  45.73 
 
 
317 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  46.05 
 
 
297 aa  246  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  45.05 
 
 
295 aa  239  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  45.73 
 
 
321 aa  235  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  44.41 
 
 
336 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  41.84 
 
 
294 aa  219  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  57.89 
 
 
194 aa  218  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  43.66 
 
 
300 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  40.93 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  38.57 
 
 
287 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  43.49 
 
 
278 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  42.23 
 
 
301 aa  205  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  44.65 
 
 
294 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  42.03 
 
 
301 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  44.57 
 
 
288 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  41.3 
 
 
287 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  44.06 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  42.27 
 
 
292 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  40.36 
 
 
286 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  41.78 
 
 
305 aa  196  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3595  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
311 aa  196  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  38.59 
 
 
288 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  40.92 
 
 
309 aa  189  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  40.68 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  40.47 
 
 
305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  40.13 
 
 
305 aa  178  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  43.56 
 
 
292 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  41.11 
 
 
292 aa  176  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  47.98 
 
 
236 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 
291 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  35.87 
 
 
291 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  35.87 
 
 
291 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 
291 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 
291 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 
287 aa  149  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  33.79 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 
282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 
290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
287 aa  109  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 
287 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 
324 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
286 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  24.83 
 
 
289 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
309 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
309 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
309 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.38 
 
 
346 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>