More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2732 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
292 aa  599  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  69.52 
 
 
292 aa  428  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  61.17 
 
 
291 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  65.2 
 
 
290 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  59.39 
 
 
293 aa  358  8e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  61.87 
 
 
300 aa  357  9e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  59.79 
 
 
296 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  58.62 
 
 
299 aa  354  7.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  59.45 
 
 
298 aa  354  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  59.11 
 
 
316 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  59.11 
 
 
297 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  59.11 
 
 
297 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  58.76 
 
 
316 aa  346  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  58.42 
 
 
323 aa  345  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  57.04 
 
 
298 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  57.04 
 
 
298 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  56.7 
 
 
298 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  58.51 
 
 
304 aa  341  8e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  57.73 
 
 
298 aa  338  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  56.21 
 
 
308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  58.39 
 
 
298 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  58.39 
 
 
298 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  57.04 
 
 
296 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  55.78 
 
 
292 aa  332  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  53.74 
 
 
312 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  56.88 
 
 
303 aa  322  4e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  51.03 
 
 
290 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  55.68 
 
 
299 aa  322  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  51.03 
 
 
290 aa  321  8e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  52.74 
 
 
297 aa  319  3e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  54.01 
 
 
308 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  54.01 
 
 
308 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  56.1 
 
 
295 aa  316  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  54.27 
 
 
301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  55.36 
 
 
297 aa  311  9e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  53.77 
 
 
292 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  53.57 
 
 
291 aa  296  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  50.69 
 
 
298 aa  292  5e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  50.71 
 
 
291 aa  291  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  47.2 
 
 
294 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  48.97 
 
 
294 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  50.84 
 
 
309 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  46.92 
 
 
298 aa  276  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  47.86 
 
 
304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  47.86 
 
 
304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  47.86 
 
 
304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  53.24 
 
 
294 aa  271  9e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  47.39 
 
 
317 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  45.21 
 
 
301 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  42.18 
 
 
302 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  44.22 
 
 
303 aa  246  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  43.54 
 
 
301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  43.49 
 
 
301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  42.12 
 
 
297 aa  229  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  41.78 
 
 
300 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  43 
 
 
295 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  44.13 
 
 
294 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  44.21 
 
 
278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  42.03 
 
 
286 aa  219  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  41.81 
 
 
294 aa  218  7.999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  40.21 
 
 
321 aa  215  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  45.09 
 
 
288 aa  212  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  53.41 
 
 
194 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  40.27 
 
 
287 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  40.2 
 
 
336 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  38.71 
 
 
313 aa  209  4e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3595  alpha/beta hydrolase fold  42.18 
 
 
311 aa  208  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  38.91 
 
 
287 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  43.29 
 
 
301 aa  205  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  41.22 
 
 
301 aa  195  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  39.58 
 
 
292 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  42.96 
 
 
292 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  36.82 
 
 
288 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  38.79 
 
 
292 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  51.15 
 
 
236 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  40.13 
 
 
309 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  37.92 
 
 
292 aa  172  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 
287 aa  171  9e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  37.81 
 
 
289 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  38.16 
 
 
305 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
305 aa  168  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
305 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 
291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 
291 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 
291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 
292 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  36.46 
 
 
283 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
290 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 
324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  31.19 
 
 
335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.94 
 
 
346 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0113  putative hydrolase protein  31.93 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal  0.0574017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  33.77 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  31.74 
 
 
306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>