More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3835 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
303 aa  629  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  54.29 
 
 
294 aa  324  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  56.23 
 
 
291 aa  316  4e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  53.85 
 
 
291 aa  310  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  54.31 
 
 
294 aa  301  7.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  48.3 
 
 
290 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  47.92 
 
 
290 aa  298  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  51.55 
 
 
295 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  49.49 
 
 
298 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 
297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  46.76 
 
 
301 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  49.48 
 
 
304 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  49.48 
 
 
304 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  49.48 
 
 
304 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  50.36 
 
 
303 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  47.96 
 
 
291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  47.86 
 
 
309 aa  272  6e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  47.96 
 
 
292 aa  272  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  48.12 
 
 
323 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  47.46 
 
 
297 aa  270  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  49.62 
 
 
300 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  48.25 
 
 
304 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  47.62 
 
 
298 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  47.62 
 
 
298 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  47.62 
 
 
298 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  46.99 
 
 
296 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  48.67 
 
 
298 aa  261  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  46.1 
 
 
293 aa  261  8.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  47.37 
 
 
298 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  45.96 
 
 
316 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  46.99 
 
 
296 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  48.67 
 
 
298 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  45.96 
 
 
297 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  45.96 
 
 
297 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  47.62 
 
 
298 aa  258  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  46.32 
 
 
316 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  45.42 
 
 
298 aa  257  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  50.55 
 
 
294 aa  256  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  49.25 
 
 
308 aa  255  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  46.62 
 
 
299 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  50.75 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  48.3 
 
 
292 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  48.4 
 
 
308 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  47.99 
 
 
299 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  44.22 
 
 
292 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  48 
 
 
308 aa  244  9e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  43.18 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  43.71 
 
 
302 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  48.3 
 
 
292 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  44.24 
 
 
312 aa  236  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  41.23 
 
 
313 aa  232  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  44.14 
 
 
297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  42.11 
 
 
301 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  42.05 
 
 
301 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 
301 aa  225  8e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  42.11 
 
 
295 aa  205  8e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  40.94 
 
 
294 aa  202  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  38.98 
 
 
300 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  52.75 
 
 
194 aa  202  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  39.44 
 
 
278 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 
336 aa  198  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  40.62 
 
 
301 aa  192  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 
301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  40.82 
 
 
292 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  37.15 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  35.91 
 
 
287 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3595  alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 
311 aa  182  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  40.07 
 
 
288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  40.58 
 
 
309 aa  179  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  39.5 
 
 
286 aa  179  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  41.33 
 
 
292 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  37.45 
 
 
291 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 
291 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  37.08 
 
 
291 aa  172  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  38.89 
 
 
292 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 
292 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  36.64 
 
 
305 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  39.26 
 
 
305 aa  169  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  36.46 
 
 
294 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  36.64 
 
 
305 aa  169  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  37.89 
 
 
289 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 
287 aa  166  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  35.23 
 
 
288 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  47.19 
 
 
236 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  37.13 
 
 
292 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 
282 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 
262 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
309 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
309 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
309 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
290 aa  109  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
283 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  31.77 
 
 
320 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 
298 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
297 aa  102  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  30.14 
 
 
294 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 
291 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>