More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2211 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  100 
 
 
320 aa  644    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  61.09 
 
 
309 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  61.09 
 
 
309 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  61.09 
 
 
309 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  41.2 
 
 
302 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  44.14 
 
 
290 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  38.81 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  39.66 
 
 
298 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  39.46 
 
 
294 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  39.01 
 
 
306 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  39.01 
 
 
306 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  39.02 
 
 
282 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  39.64 
 
 
297 aa  189  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  37.69 
 
 
262 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  37.85 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 
298 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 
324 aa  175  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  36.45 
 
 
335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  35.23 
 
 
309 aa  172  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  38.49 
 
 
291 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  38.13 
 
 
291 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  37.96 
 
 
291 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  37.96 
 
 
291 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  37.96 
 
 
291 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 
291 aa  159  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  35.46 
 
 
335 aa  159  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  38.06 
 
 
312 aa  158  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  34.04 
 
 
321 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  32.91 
 
 
346 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 
287 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  36.49 
 
 
284 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.47 
 
 
341 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 
291 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  32.49 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  33.79 
 
 
348 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 
278 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
287 aa  142  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  36.06 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 
302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  30.75 
 
 
311 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  34.24 
 
 
306 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
291 aa  135  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 
304 aa  135  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 
302 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8637  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 
370 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
302 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  31.25 
 
 
317 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  32.08 
 
 
303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 
351 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 
281 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
315 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 
290 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 
294 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2119  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 
307 aa  123  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
289 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
289 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 
300 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  34.18 
 
 
278 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  36.86 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.75 
 
 
293 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 
288 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  32.3 
 
 
288 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  37.67 
 
 
288 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 
290 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
288 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
290 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 
298 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
294 aa  105  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  34.27 
 
 
304 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 
303 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 
298 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 
298 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5733  alpha/beta hydrolase fold protein  30.66 
 
 
288 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
309 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  32.14 
 
 
316 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  31.08 
 
 
295 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 
298 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 
292 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  29.11 
 
 
301 aa  102  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  31.79 
 
 
316 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  31.96 
 
 
292 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  31.79 
 
 
297 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  31.79 
 
 
297 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 
296 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
287 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
291 aa  99  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  32.04 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  31.49 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  24.47 
 
 
286 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 
305 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 
298 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
312 aa  97.4  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  32.08 
 
 
297 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  29.43 
 
 
301 aa  96.3  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>