More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3194 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
309 aa  634    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  63.16 
 
 
301 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  60.39 
 
 
317 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  54.52 
 
 
296 aa  318  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  53.97 
 
 
316 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  54.18 
 
 
297 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  54.18 
 
 
297 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  53.67 
 
 
297 aa  312  4.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  53.97 
 
 
316 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  53.18 
 
 
323 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  53.18 
 
 
296 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  52.51 
 
 
298 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  52.51 
 
 
298 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  52.51 
 
 
298 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  54.61 
 
 
303 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  51.84 
 
 
298 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  52.96 
 
 
300 aa  299  5e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  52.51 
 
 
298 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  51.68 
 
 
293 aa  296  4e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  53.47 
 
 
298 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  48.01 
 
 
312 aa  293  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  53.56 
 
 
290 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  53.56 
 
 
290 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  53.12 
 
 
298 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  50.68 
 
 
294 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  52.01 
 
 
294 aa  290  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  51.68 
 
 
291 aa  289  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  48.34 
 
 
298 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  50.84 
 
 
299 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  54.44 
 
 
291 aa  286  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  50.84 
 
 
292 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  50.67 
 
 
308 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  51.17 
 
 
308 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  51.57 
 
 
291 aa  285  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  50.34 
 
 
308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  52 
 
 
295 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  50.84 
 
 
292 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  50.87 
 
 
297 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  47.86 
 
 
303 aa  272  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  52.43 
 
 
304 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  50.71 
 
 
299 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  46.33 
 
 
302 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  50.53 
 
 
290 aa  264  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  45.33 
 
 
301 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  47.3 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  50.69 
 
 
292 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  45.15 
 
 
301 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  46.69 
 
 
304 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  46.69 
 
 
304 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  43.42 
 
 
301 aa  245  6.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  46.69 
 
 
304 aa  244  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  51.13 
 
 
292 aa  236  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  42.45 
 
 
313 aa  226  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  48.78 
 
 
294 aa  225  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  43.85 
 
 
297 aa  225  7e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  44.44 
 
 
295 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  44.67 
 
 
301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  43.06 
 
 
294 aa  216  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  44.82 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  54.01 
 
 
194 aa  203  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  44.04 
 
 
300 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  42.36 
 
 
278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3595  alpha/beta hydrolase fold  43.71 
 
 
311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  41.16 
 
 
294 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  42.35 
 
 
309 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  42.09 
 
 
292 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  44.33 
 
 
288 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  39.34 
 
 
287 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  39.39 
 
 
305 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  40.48 
 
 
292 aa  189  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  38.69 
 
 
287 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  40.92 
 
 
305 aa  185  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  40.92 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  39.18 
 
 
336 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  38.52 
 
 
286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  40 
 
 
292 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  38.87 
 
 
289 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  36.12 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  40.28 
 
 
292 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  35.22 
 
 
288 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  44.5 
 
 
236 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  37.73 
 
 
291 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  37.64 
 
 
291 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  37.64 
 
 
291 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  37.36 
 
 
291 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 
291 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  35.06 
 
 
287 aa  149  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  33.78 
 
 
309 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  33.78 
 
 
309 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  33.78 
 
 
309 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 
291 aa  109  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
290 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
283 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 
321 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  30 
 
 
320 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 
311 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  27.45 
 
 
291 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>