More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2748 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
311 aa  646    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  46.46 
 
 
291 aa  293  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  43.29 
 
 
291 aa  281  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  32.07 
 
 
283 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  35.03 
 
 
335 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 
302 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  36.77 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  36.77 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  34.49 
 
 
309 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  33.79 
 
 
302 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 
324 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  32.64 
 
 
297 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 
309 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 
309 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 
309 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  32.99 
 
 
321 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
290 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 
302 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  34.35 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  32.64 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 
282 aa  146  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  34.25 
 
 
312 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.93 
 
 
346 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 
291 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 
340 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  30.56 
 
 
294 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 
335 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
291 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
291 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 
291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 
291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
348 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  30.75 
 
 
320 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.15 
 
 
341 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 
306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
287 aa  135  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  30.93 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  31.63 
 
 
317 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  33.11 
 
 
295 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
296 aa  132  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 
287 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 
304 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 
302 aa  125  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 
262 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 
309 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 
292 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 
289 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 
289 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
351 aa  122  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 
303 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 
278 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
301 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 
284 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
297 aa  109  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0851  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
320 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
287 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  35.62 
 
 
307 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
286 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  27.06 
 
 
290 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  27.06 
 
 
290 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 
292 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  28.71 
 
 
297 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  43.65 
 
 
289 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  44.53 
 
 
305 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 
301 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
291 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 
309 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 
292 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
291 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8637  alpha/beta hydrolase fold protein  25.08 
 
 
370 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  30.13 
 
 
301 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  28.71 
 
 
292 aa  102  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
298 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
308 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  29.97 
 
 
292 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  30 
 
 
295 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
310 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
312 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 
294 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  36.76 
 
 
301 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
270 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  43.36 
 
 
291 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  41.94 
 
 
294 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
281 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 
294 aa  100  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 
308 aa  99  8e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  36.51 
 
 
311 aa  99  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
302 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  38.06 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
300 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
303 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  40.32 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 
308 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  36.92 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>