More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0310 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 324 aa  664    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  37.96 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  37.32 
 
 		 294 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 		 290 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 306 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 306 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  35.15 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  35.15 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  35.15 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  37.19 
 
 		 335 aa  182  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  35.23 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  36.86 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 		 297 aa  176  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  34.06 
 
 		 283 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  34.13 
 
 		 309 aa  172  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  37.78 
 
 		 321 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  34.77 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  35.94 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  33.68 
 
 		 340 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.05 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  33.44 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  36.2 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  36.2 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  36.2 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 302 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  35.36 
 
 		 306 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 		 281 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 		 287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  33.09 
 
 		 317 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 		 348 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  35.23 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  34.16 
 
 		 296 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  33.11 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  35.21 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 		 289 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 289 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  33.09 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 		 278 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8637  alpha/beta hydrolase fold protein  32.92 
 
 		 370 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  31.62 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0771  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 294 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 		 294 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 		 290 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 		 303 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2119  alpha/beta hydrolase fold  34.34 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  34.82 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 287 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 292 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  30.46 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  33.79 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1843  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00347923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  32.29 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 284 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 298 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1705  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565807 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  31.94 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  31.94 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  31.94 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.96 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  32.76 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  31.93 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  33.68 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 298 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  31.29 
 
 		 298 aa  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  31.91 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0851  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 320 aa  112  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  31.67 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>