More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2139 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
292 aa  578  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  83.22 
 
 
292 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  77.43 
 
 
289 aa  444  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  76.45 
 
 
305 aa  437  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  71.92 
 
 
292 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  71.23 
 
 
292 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  66.1 
 
 
292 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  44.9 
 
 
294 aa  227  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  45.21 
 
 
291 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  46.21 
 
 
308 aa  219  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  40.14 
 
 
290 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  45.7 
 
 
291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  39.79 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  45.64 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  44.52 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  40.58 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  44.67 
 
 
308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  45.16 
 
 
299 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  45.79 
 
 
299 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  45.2 
 
 
278 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  41.89 
 
 
304 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  45.21 
 
 
292 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  41.89 
 
 
304 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  41.89 
 
 
304 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  43.58 
 
 
295 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  43.99 
 
 
308 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  42.96 
 
 
300 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  43.2 
 
 
302 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  44.06 
 
 
304 aa  205  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  42.61 
 
 
301 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  43.69 
 
 
297 aa  203  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  47.81 
 
 
294 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  45.02 
 
 
323 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  42.71 
 
 
293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  42.12 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  42.27 
 
 
301 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  41.69 
 
 
297 aa  199  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  45.28 
 
 
296 aa  198  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  45.73 
 
 
294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  45.9 
 
 
292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  43.09 
 
 
298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  44.07 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  43.12 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  43.84 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  44.06 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  43.12 
 
 
297 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  43.12 
 
 
297 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  43.2 
 
 
321 aa  195  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  41.75 
 
 
298 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  42.96 
 
 
292 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  44.49 
 
 
298 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  44.49 
 
 
298 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  42.09 
 
 
309 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  44.12 
 
 
298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  43.85 
 
 
290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  42.65 
 
 
298 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  43.87 
 
 
298 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  43.58 
 
 
336 aa  188  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  44.53 
 
 
298 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  44.15 
 
 
298 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 
312 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  40.78 
 
 
291 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  40.82 
 
 
303 aa  186  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  41.32 
 
 
295 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  43.45 
 
 
292 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  40.61 
 
 
294 aa  180  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  42.96 
 
 
301 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  41.89 
 
 
301 aa  175  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  43.15 
 
 
303 aa  175  7e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3595  alpha/beta hydrolase fold  40.27 
 
 
311 aa  172  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  40.92 
 
 
309 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  38.41 
 
 
287 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  40.07 
 
 
286 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  40.97 
 
 
317 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  40.57 
 
 
291 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  44.64 
 
 
288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  40.57 
 
 
291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  40.57 
 
 
291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  40.57 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  35.86 
 
 
287 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 
287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  39.86 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  43.59 
 
 
305 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  43.12 
 
 
305 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  46.47 
 
 
194 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  33.89 
 
 
313 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  38.83 
 
 
288 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  45.61 
 
 
236 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
282 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 
283 aa  122  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
302 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  31.31 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  30.54 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  32.49 
 
 
346 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 
321 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  26.26 
 
 
290 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  33.11 
 
 
335 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>