More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3580 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
309 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
309 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
309 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  61.09 
 
 
320 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  43.1 
 
 
290 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  39.22 
 
 
297 aa  203  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  39.18 
 
 
298 aa  202  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  37.28 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  41.13 
 
 
294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  39.3 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  39.3 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  39.54 
 
 
262 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  38.73 
 
 
291 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  38.73 
 
 
291 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  38.73 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  38.73 
 
 
291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  38.73 
 
 
291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  36.81 
 
 
287 aa  179  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  35.15 
 
 
324 aa  178  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  37.13 
 
 
298 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  37.2 
 
 
319 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  37.06 
 
 
282 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  34.52 
 
 
309 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  32.87 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
283 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  35.76 
 
 
335 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 
292 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  35.69 
 
 
335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 
291 aa  163  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  34.03 
 
 
321 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  33.99 
 
 
348 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  33.01 
 
 
340 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  32.86 
 
 
346 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 
306 aa  152  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.99 
 
 
341 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  34.66 
 
 
312 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  35.82 
 
 
278 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  32.53 
 
 
311 aa  149  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 
302 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  30.79 
 
 
317 aa  148  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 
284 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  34.16 
 
 
296 aa  142  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8637  alpha/beta hydrolase fold protein  29.5 
 
 
370 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  32.55 
 
 
302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  34.23 
 
 
309 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 
302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  34.13 
 
 
303 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 
278 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
288 aa  139  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  34.15 
 
 
288 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
304 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  34.74 
 
 
288 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 
291 aa  136  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
287 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 
281 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  33.78 
 
 
309 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
286 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 
290 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 
289 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  32.34 
 
 
294 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 
289 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
284 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 
351 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  30.13 
 
 
301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 
290 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2119  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 
307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 
287 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  29.5 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  31.23 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
303 aa  113  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 
294 aa  112  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 
291 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  31.23 
 
 
316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  32.04 
 
 
297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  31.74 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  31.23 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  31.23 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 
295 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.25 
 
 
293 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  32.88 
 
 
301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  32.99 
 
 
307 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  29.35 
 
 
301 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 
301 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
288 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5733  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
288 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 
296 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 
299 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
298 aa  106  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 
291 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 
298 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0851  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 
320 aa  105  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
312 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>