More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0851 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0851  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
320 aa  660    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  56.37 
 
 
317 aa  335  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  54.51 
 
 
306 aa  317  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  54.48 
 
 
296 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  52.98 
 
 
302 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  51.66 
 
 
302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  52 
 
 
302 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  51.2 
 
 
302 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  47.71 
 
 
304 aa  271  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  43.91 
 
 
321 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  36.7 
 
 
312 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  35.81 
 
 
309 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  38.67 
 
 
292 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  32.49 
 
 
346 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
283 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
290 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2627  alpha/beta hydrolase  32.69 
 
 
289 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  34.6 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  34.6 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 
351 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 
291 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  29.57 
 
 
319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 
311 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 
324 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 
309 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 
309 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 
309 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  29.74 
 
 
309 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
291 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
287 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
284 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
262 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
278 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 
335 aa  96.3  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  31.21 
 
 
294 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  28.96 
 
 
301 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
302 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 
312 aa  90.5  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 
289 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  27.02 
 
 
320 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
348 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.47 
 
 
341 aa  86.3  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5733  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  26.17 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 
297 aa  77  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 
286 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  26.01 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  25.82 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  25.82 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  24.66 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 
292 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 
287 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  26.87 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  25.49 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  25.36 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  24.2 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  24.2 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  28.27 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1705  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565807 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  28.33 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  25.37 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  25.37 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
336 aa  65.9  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>