More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3621 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
335 aa  677    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  41.84 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  41.79 
 
 
283 aa  220  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  38.19 
 
 
319 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  41.72 
 
 
306 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  41.72 
 
 
306 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  38.21 
 
 
282 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  39.79 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  39.72 
 
 
321 aa  196  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 
302 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  36 
 
 
346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 
302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 
284 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  39.31 
 
 
304 aa  180  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  36.54 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  37.98 
 
 
294 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 
302 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
297 aa  169  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  34.34 
 
 
302 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  36.92 
 
 
262 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
309 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
309 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
309 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 
298 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  35.03 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  33.44 
 
 
317 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  35.15 
 
 
311 aa  162  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.63 
 
 
341 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  36.69 
 
 
278 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  35.39 
 
 
296 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  35.81 
 
 
335 aa  159  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 
290 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  35.46 
 
 
287 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  32.87 
 
 
291 aa  155  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
291 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
291 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
291 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 
348 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
291 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 
292 aa  149  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  34.14 
 
 
351 aa  149  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 
291 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  35.84 
 
 
298 aa  146  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 
287 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  31.99 
 
 
302 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0851  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
320 aa  135  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 
289 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  35.07 
 
 
278 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 
289 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 
298 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 
303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 
291 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  31.35 
 
 
309 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 
290 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
295 aa  126  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
299 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 
294 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
292 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 
284 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 
292 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  31.89 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  33.69 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
290 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 
305 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
286 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  28.23 
 
 
290 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1047  alpha/beta hydrolase fold  34.06 
 
 
275 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  31.97 
 
 
301 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
301 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
291 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2627  alpha/beta hydrolase  31.56 
 
 
289 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
288 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 
298 aa  107  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 
291 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 
297 aa  106  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
300 aa  106  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
281 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 
294 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
336 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  30.5 
 
 
304 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  30.5 
 
 
304 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 
301 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
298 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 
302 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  30.5 
 
 
304 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  32.78 
 
 
292 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  29.05 
 
 
296 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
300 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8637  alpha/beta hydrolase fold protein  28.66 
 
 
370 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
321 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  29.7 
 
 
292 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 
291 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>