More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3257 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
302 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  96.69 
 
 
302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  88.41 
 
 
302 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  71.97 
 
 
302 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  59.93 
 
 
317 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  61.84 
 
 
306 aa  371  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  60.34 
 
 
296 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  55.59 
 
 
304 aa  335  7e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0851  alpha/beta hydrolase fold  51.86 
 
 
320 aa  301  7.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  47.1 
 
 
321 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  49.41 
 
 
312 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  38.82 
 
 
309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  37.37 
 
 
346 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  41.73 
 
 
292 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
290 aa  168  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  35.02 
 
 
283 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  34.34 
 
 
335 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  36.65 
 
 
306 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  36.65 
 
 
306 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  34.16 
 
 
294 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  32.59 
 
 
319 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 
282 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2627  alpha/beta hydrolase  37.16 
 
 
289 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 
311 aa  149  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  33.94 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  35.97 
 
 
284 aa  146  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 
309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  35.31 
 
 
335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 
309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 
309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  34.04 
 
 
348 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
291 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
291 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  32.82 
 
 
262 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
291 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.1 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  34.47 
 
 
351 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  31.05 
 
 
320 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
287 aa  133  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  33.1 
 
 
340 aa  132  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 
291 aa  129  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 
298 aa  125  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 
278 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  34.92 
 
 
292 aa  122  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  32.78 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 
302 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5733  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  32.3 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 
290 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  29.25 
 
 
301 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  29.87 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  31.61 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  30.54 
 
 
292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
291 aa  109  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  31.41 
 
 
292 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 
291 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
301 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
294 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 
292 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
312 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  29.87 
 
 
295 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  30.1 
 
 
294 aa  106  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 
292 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
301 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 
297 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  29.18 
 
 
304 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  29.18 
 
 
304 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  29.18 
 
 
304 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
291 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  35.41 
 
 
294 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  28.33 
 
 
294 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 
288 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 
303 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 
287 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  25.81 
 
 
289 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  32.28 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  34.93 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 
305 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
301 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 
290 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
284 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
291 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  27.93 
 
 
293 aa  97.1  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
287 aa  97.1  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 
309 aa  95.9  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  33.18 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 
340 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>