More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1736 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
290 aa  584  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  43.1 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  43.1 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  43.1 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  44.14 
 
 
320 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 
283 aa  192  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  41.81 
 
 
306 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  41.81 
 
 
306 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  41.7 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  39.51 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  38.78 
 
 
262 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  40.14 
 
 
291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  42.21 
 
 
292 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  40.14 
 
 
291 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 
324 aa  179  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  41.82 
 
 
291 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  40.14 
 
 
297 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  39.21 
 
 
321 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  41.09 
 
 
291 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  41.09 
 
 
291 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  37.18 
 
 
309 aa  175  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  38.91 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 
302 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  38.04 
 
 
302 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  38.41 
 
 
312 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
302 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  36.86 
 
 
302 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  39.25 
 
 
294 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  37.83 
 
 
302 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 
298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  39.34 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  36.17 
 
 
282 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  39.37 
 
 
335 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.46 
 
 
341 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 
296 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  35.66 
 
 
317 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  37.09 
 
 
346 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  36.45 
 
 
335 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  32.52 
 
 
291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  37.1 
 
 
348 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  37.28 
 
 
340 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
291 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
287 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 
304 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  32.08 
 
 
311 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  35.14 
 
 
319 aa  148  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  35.23 
 
 
298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  37.05 
 
 
281 aa  145  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
290 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 
291 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 
303 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 
312 aa  142  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 
291 aa  142  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  37.5 
 
 
292 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
292 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  36.1 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
290 aa  138  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  34.8 
 
 
278 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  39.37 
 
 
300 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  37.28 
 
 
292 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  32.45 
 
 
301 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 
284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  35.23 
 
 
295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  37.23 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  37.23 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  37.23 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 
288 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
288 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  37.06 
 
 
316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  36.77 
 
 
288 aa  132  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 
292 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 
296 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  37.06 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  35.81 
 
 
298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 
284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  36.76 
 
 
298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  37.73 
 
 
298 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  35.36 
 
 
323 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  36.76 
 
 
298 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  32.51 
 
 
294 aa  129  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
305 aa  129  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 
286 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 
298 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  36.49 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  35.64 
 
 
298 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8637  alpha/beta hydrolase fold protein  30.46 
 
 
370 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  37.59 
 
 
304 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
294 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0851  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
320 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.26 
 
 
293 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  36.03 
 
 
289 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>