More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5344 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  100 
 
 
317 aa  653    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  68.09 
 
 
306 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  63.45 
 
 
296 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  62.68 
 
 
302 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  60.27 
 
 
302 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  59.93 
 
 
302 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  60.93 
 
 
302 aa  371  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  55.48 
 
 
304 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0851  alpha/beta hydrolase fold  57.68 
 
 
320 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  48.72 
 
 
321 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  43.86 
 
 
312 aa  228  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  42.55 
 
 
309 aa  200  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  34.8 
 
 
346 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 
283 aa  172  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 
292 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 
335 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  35.21 
 
 
306 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  35.21 
 
 
306 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 
290 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 
282 aa  155  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
324 aa  149  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  30.79 
 
 
309 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  30.79 
 
 
309 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  30.79 
 
 
309 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2627  alpha/beta hydrolase  35.77 
 
 
289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  31.45 
 
 
294 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  31.89 
 
 
319 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
297 aa  143  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  34.1 
 
 
351 aa  136  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
298 aa  135  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 
278 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 
298 aa  135  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  31.63 
 
 
311 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 
291 aa  132  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  31.25 
 
 
320 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 
340 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  32.44 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.03 
 
 
341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  31.79 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5733  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 
291 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
291 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  29.11 
 
 
348 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 
291 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  30.43 
 
 
301 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  30.98 
 
 
304 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 
295 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  31.08 
 
 
297 aa  109  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  30.64 
 
 
304 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  30.64 
 
 
304 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
292 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
300 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
289 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
302 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
294 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
292 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  30.24 
 
 
294 aa  102  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
301 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
294 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
309 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  27.76 
 
 
292 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
292 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
294 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 
305 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0771  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 
312 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 
292 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
297 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
291 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1705  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
321 aa  99.8  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565807 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
312 aa  99  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
286 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 
305 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  27.34 
 
 
293 aa  97.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
315 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 
281 aa  96.3  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
301 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 
298 aa  95.5  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  29.15 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  26.44 
 
 
308 aa  94  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  24.04 
 
 
287 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
294 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  24.83 
 
 
294 aa  93.6  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 
290 aa  92.8  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 
309 aa  92.8  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
291 aa  92.4  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  26.78 
 
 
308 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>