More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1760 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 302 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  89.07 
 
 		 302 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  88.41 
 
 		 302 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  72.32 
 
 		 302 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  62.81 
 
 		 306 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  60.93 
 
 		 317 aa  371  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  62.06 
 
 		 296 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  56.11 
 
 		 304 aa  351  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0851  alpha/beta hydrolase fold  53.63 
 
 		 320 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  47.1 
 
 		 321 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  48.66 
 
 		 312 aa  248  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  39.62 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  37.72 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  36.07 
 
 		 335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  42.49 
 
 		 292 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 		 290 aa  172  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  35.02 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  35.94 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  35.04 
 
 		 278 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2627  alpha/beta hydrolase  38.46 
 
 		 289 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  32.28 
 
 		 319 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  35.97 
 
 		 284 aa  148  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  33.11 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 		 335 aa  145  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  32.99 
 
 		 348 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 		 262 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 		 291 aa  138  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 287 aa  138  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.75 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 		 351 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 		 340 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  33.09 
 
 		 320 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  34.06 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  34.24 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5733  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 		 288 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  31.88 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  29.19 
 
 		 312 aa  112  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  29.93 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  30.2 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  30.85 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  29.82 
 
 		 294 aa  109  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  31.38 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 292 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  29.45 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  29.51 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  29.51 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  29.83 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  29.51 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 294 aa  99  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 284 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  33.49 
 
 		 294 aa  99  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  32.72 
 
 		 294 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 		 286 aa  96.3  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 287 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 287 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>