More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_26090 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  100 
 
 
319 aa  662    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  39.24 
 
 
335 aa  222  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  34.39 
 
 
309 aa  186  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  37.68 
 
 
321 aa  185  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  37.85 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  37.42 
 
 
306 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  37.42 
 
 
306 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  36.99 
 
 
309 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  36.99 
 
 
309 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  36.99 
 
 
309 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  35.89 
 
 
298 aa  169  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  35.64 
 
 
294 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 
298 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  33.23 
 
 
302 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 
348 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  33.54 
 
 
302 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
302 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  34.4 
 
 
312 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 
297 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
302 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  33.99 
 
 
306 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
283 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
290 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 
340 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
304 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  32.57 
 
 
296 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.22 
 
 
341 aa  148  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  34.24 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  32.23 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
282 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  32.32 
 
 
262 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.45 
 
 
346 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 
292 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  30.93 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  31.69 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
291 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 
291 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 
291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 
291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  31.1 
 
 
278 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 
303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 
284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
291 aa  119  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
351 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0851  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 
290 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 
290 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 
278 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  31.88 
 
 
290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
292 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  23.34 
 
 
290 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
292 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
297 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
293 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  25.08 
 
 
289 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  30.85 
 
 
294 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  24.75 
 
 
289 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  32.98 
 
 
295 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 
301 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 
300 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
297 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  28.43 
 
 
301 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 
297 aa  102  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 
291 aa  102  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 
298 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 
281 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
299 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  30.64 
 
 
299 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 
315 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 
291 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 
302 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
288 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 
304 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  26.99 
 
 
294 aa  96.7  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
298 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
298 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
312 aa  96.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
298 aa  96.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
298 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
291 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  29.9 
 
 
293 aa  96.3  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 
298 aa  95.9  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 
301 aa  95.9  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 
287 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  29.68 
 
 
297 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  29.68 
 
 
297 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  29.68 
 
 
316 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 
284 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
291 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  29.82 
 
 
313 aa  95.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  23.93 
 
 
286 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5733  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 
288 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 
294 aa  94  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  30.66 
 
 
323 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>