More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2809 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 302 aa  627  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  41.2 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  37.28 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  37.28 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  37.28 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  40.56 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  34.81 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  35.4 
 
 		 294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  37.83 
 
 		 290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 351 aa  153  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  35.36 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  34.09 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 		 292 aa  148  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 		 283 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.12 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  31.99 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  34.24 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  34.24 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 287 aa  139  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 		 291 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 291 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  30.55 
 
 		 321 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  31.69 
 
 		 319 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  31.64 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  31.52 
 
 		 348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 		 291 aa  129  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 304 aa  128  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  31.41 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5733  alpha/beta hydrolase fold protein  30.99 
 
 		 288 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 		 311 aa  125  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 		 296 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 306 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 340 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  27.15 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  29.29 
 
 		 312 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0851  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  26.43 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  29.5 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  29.5 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  29.5 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8637  alpha/beta hydrolase fold protein  25.4 
 
 		 370 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.14 
 
 		 293 aa  99.8  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  28.78 
 
 		 316 aa  99  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  25.36 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  28.22 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2119  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 		 307 aa  96.7  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 291 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 		 295 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 299 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  28.88 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 301 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  27.74 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 		 286 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 296 aa  89  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  24.28 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  28.85 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  29.46 
 
 		 304 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>