More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1083 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 291 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  98.97 
 
 		 291 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  90.38 
 
 		 291 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  89.69 
 
 		 291 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  89.69 
 
 		 291 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  76.14 
 
 		 287 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  47.86 
 
 		 278 aa  246  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  40.36 
 
 		 304 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  40.36 
 
 		 304 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  40.36 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  37.32 
 
 		 290 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  39.78 
 
 		 291 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  36.96 
 
 		 290 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  39.58 
 
 		 295 aa  188  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  38.73 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  39.38 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  38.73 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  38.73 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  41.76 
 
 		 290 aa  183  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  39.34 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  40.14 
 
 		 290 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 		 291 aa  179  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  37.63 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  38.21 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  38.11 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  41.69 
 
 		 292 aa  172  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  37.08 
 
 		 303 aa  172  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  38.49 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 		 291 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  39.58 
 
 		 292 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  41.09 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 		 300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  37.89 
 
 		 297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  40.57 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  37.23 
 
 		 293 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  39.65 
 
 		 294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  35.27 
 
 		 291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  37.19 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  34.84 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  37.41 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 		 288 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  36.68 
 
 		 316 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  35.31 
 
 		 287 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  36.68 
 
 		 297 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  36.68 
 
 		 297 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  33.92 
 
 		 321 aa  161  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  36.33 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  34.23 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  37.83 
 
 		 312 aa  159  6e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  31.29 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  31.29 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  39.85 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  36.86 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  36.9 
 
 		 297 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  34.03 
 
 		 282 aa  155  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  36.49 
 
 		 295 aa  155  8e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 		 299 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  35.82 
 
 		 294 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 		 284 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  37.36 
 
 		 309 aa  155  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  36.69 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  36.55 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  38.62 
 
 		 303 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  35.89 
 
 		 296 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 		 324 aa  152  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  35.97 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  37.84 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 		 298 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 		 298 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  35.56 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  36.6 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  32.86 
 
 		 335 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  37.64 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  36.69 
 
 		 292 aa  149  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  33.79 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  37.64 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  38.16 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  35.71 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  36.3 
 
 		 301 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  35.87 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  38.22 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>