More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2985 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
298 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  99.66 
 
 
298 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  99.66 
 
 
298 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  96.64 
 
 
298 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  91.25 
 
 
298 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  87.21 
 
 
316 aa  544  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  87.88 
 
 
316 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  87.21 
 
 
297 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  87.21 
 
 
297 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  94.1 
 
 
298 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  93.75 
 
 
298 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  79.86 
 
 
323 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  79.18 
 
 
296 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  78.16 
 
 
296 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  66.09 
 
 
299 aa  401  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  67.82 
 
 
308 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  66.44 
 
 
308 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  66.44 
 
 
308 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  62.89 
 
 
293 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  62.2 
 
 
292 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  63.23 
 
 
299 aa  368  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  64.58 
 
 
304 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  61.25 
 
 
291 aa  360  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  62.54 
 
 
300 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  60.34 
 
 
292 aa  349  4e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  56.7 
 
 
292 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  58.08 
 
 
297 aa  332  5e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  63.1 
 
 
290 aa  322  5e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  52.36 
 
 
312 aa  322  6e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  59.66 
 
 
292 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  50.87 
 
 
290 aa  315  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  50.52 
 
 
290 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  58.3 
 
 
303 aa  312  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  52.51 
 
 
309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  53.63 
 
 
291 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  52.25 
 
 
291 aa  300  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  56.13 
 
 
298 aa  299  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  52.9 
 
 
301 aa  299  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  52.6 
 
 
295 aa  291  7e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  49.48 
 
 
294 aa  291  8e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  47.44 
 
 
294 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  51.75 
 
 
297 aa  290  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  47.42 
 
 
301 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  48.11 
 
 
301 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  46.42 
 
 
302 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  48.45 
 
 
298 aa  276  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  46.42 
 
 
301 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  53.93 
 
 
294 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  47.62 
 
 
303 aa  263  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  48.34 
 
 
304 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  47.97 
 
 
304 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  47.97 
 
 
304 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  50.72 
 
 
317 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  46.05 
 
 
297 aa  253  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  45.62 
 
 
295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  42.7 
 
 
313 aa  230  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  46.08 
 
 
321 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  56.32 
 
 
194 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  44.03 
 
 
300 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  43.05 
 
 
336 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  41.69 
 
 
294 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  44.98 
 
 
278 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  44.26 
 
 
301 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  40.27 
 
 
287 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  44.93 
 
 
301 aa  209  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  45.76 
 
 
294 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  45.65 
 
 
288 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  42.45 
 
 
286 aa  202  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3595  alpha/beta hydrolase fold  40.88 
 
 
311 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  39.49 
 
 
287 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  40.96 
 
 
288 aa  195  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  44.12 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  38.67 
 
 
305 aa  188  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  41.58 
 
 
309 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  41.38 
 
 
292 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  40.64 
 
 
292 aa  185  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  41.47 
 
 
305 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  41.14 
 
 
305 aa  178  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  39.13 
 
 
289 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  41.39 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  40.22 
 
 
292 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  48.55 
 
 
236 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 
287 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 
291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 
291 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 
283 aa  149  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 
291 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  37.73 
 
 
290 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 
282 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.4 
 
 
346 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
287 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 
292 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  34.9 
 
 
294 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 
284 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 
291 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  32.08 
 
 
301 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>