More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_37530 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  100 
 
 
300 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  49.66 
 
 
321 aa  268  8e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  50.34 
 
 
336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  47.42 
 
 
297 aa  264  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3595  alpha/beta hydrolase fold  48.97 
 
 
311 aa  262  6e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  47.46 
 
 
298 aa  261  8.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  45.24 
 
 
302 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  44.14 
 
 
290 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  48.45 
 
 
297 aa  259  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  47.44 
 
 
301 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  43.79 
 
 
290 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  47.39 
 
 
299 aa  254  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  51.09 
 
 
303 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  45.73 
 
 
291 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  44.03 
 
 
301 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  45.73 
 
 
291 aa  246  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  44.48 
 
 
292 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  45.36 
 
 
294 aa  245  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  45.61 
 
 
300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  42.86 
 
 
301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  45.26 
 
 
316 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  46.32 
 
 
299 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  45.62 
 
 
316 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  45.26 
 
 
297 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  45.26 
 
 
297 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  44.22 
 
 
295 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  44.48 
 
 
291 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  45.65 
 
 
293 aa  234  9e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  46.1 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  41.78 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  41.38 
 
 
294 aa  232  5e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  44.4 
 
 
298 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  44.4 
 
 
298 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  44.49 
 
 
308 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  43.27 
 
 
298 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  44.16 
 
 
308 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  43.34 
 
 
298 aa  230  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  44.03 
 
 
298 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  44.12 
 
 
296 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  44.03 
 
 
323 aa  228  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  43.66 
 
 
296 aa  228  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  42.66 
 
 
297 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  42.76 
 
 
308 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  45.15 
 
 
298 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  45.66 
 
 
298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  45.28 
 
 
298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  43.84 
 
 
294 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  41.64 
 
 
292 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  43.49 
 
 
295 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  42.7 
 
 
290 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  43.15 
 
 
304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  44.33 
 
 
294 aa  216  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  39.66 
 
 
304 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  39.66 
 
 
304 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  39.66 
 
 
304 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  39.72 
 
 
312 aa  215  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  42.12 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 
303 aa  211  7.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  44.04 
 
 
309 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  41.5 
 
 
292 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  46.26 
 
 
294 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  38.7 
 
 
287 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  37.06 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  37.71 
 
 
287 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  40.96 
 
 
292 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  41.61 
 
 
286 aa  195  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  40.65 
 
 
278 aa  192  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  38.41 
 
 
292 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  46.15 
 
 
288 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  39.93 
 
 
289 aa  189  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  46.6 
 
 
194 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  42.23 
 
 
301 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  37.79 
 
 
317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  38.91 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  38.78 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  41.89 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  39.94 
 
 
309 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 
292 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  41.18 
 
 
305 aa  175  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  40.85 
 
 
305 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  37.02 
 
 
292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  35.57 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  35.23 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  35.23 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.84 
 
 
291 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  44.25 
 
 
236 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 
283 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  32.64 
 
 
282 aa  119  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 
297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  31.27 
 
 
294 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 
351 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 
290 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
298 aa  99.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25.54 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  33.79 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 
294 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  27.46 
 
 
346 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>