More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0129 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
299 aa  607  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  79.53 
 
 
299 aa  494  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  74.83 
 
 
308 aa  428  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  74.48 
 
 
308 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  74.48 
 
 
308 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  62.84 
 
 
316 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  64.26 
 
 
298 aa  388  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  61.82 
 
 
316 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  63.57 
 
 
298 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  63.57 
 
 
298 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  63.23 
 
 
298 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  63.57 
 
 
323 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  62.89 
 
 
297 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  62.89 
 
 
297 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  62.2 
 
 
296 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  62.63 
 
 
296 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  63.57 
 
 
298 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  63.89 
 
 
298 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  63.54 
 
 
298 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  59.73 
 
 
293 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  60.75 
 
 
304 aa  357  9e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  58.08 
 
 
292 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  57.53 
 
 
297 aa  346  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  58.62 
 
 
292 aa  345  4e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  55.67 
 
 
292 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  56.08 
 
 
312 aa  342  4e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  57.04 
 
 
291 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  57.59 
 
 
300 aa  339  2.9999999999999998e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  51.55 
 
 
290 aa  325  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  51.55 
 
 
290 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  58.24 
 
 
290 aa  320  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  55.17 
 
 
291 aa  315  5e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  58.09 
 
 
292 aa  312  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  56.88 
 
 
303 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  52.07 
 
 
291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  52.07 
 
 
297 aa  302  5.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  52.9 
 
 
301 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  49.66 
 
 
294 aa  294  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  52.67 
 
 
298 aa  289  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  51.85 
 
 
298 aa  288  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  51.22 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  44.95 
 
 
294 aa  280  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  50.52 
 
 
295 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  48.7 
 
 
304 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  48.7 
 
 
304 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  48.63 
 
 
301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  48.7 
 
 
304 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  47.99 
 
 
303 aa  264  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  47.26 
 
 
297 aa  263  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  45.24 
 
 
302 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  44.9 
 
 
301 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  44.56 
 
 
301 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  49.28 
 
 
317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  47.6 
 
 
294 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  45.86 
 
 
300 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  44.56 
 
 
294 aa  230  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  41.98 
 
 
295 aa  225  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  47.49 
 
 
301 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  43.99 
 
 
321 aa  222  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  56.82 
 
 
194 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  43.62 
 
 
313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 
278 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  45.23 
 
 
292 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  43.1 
 
 
292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3595  alpha/beta hydrolase fold  41.24 
 
 
311 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  42.81 
 
 
301 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  41.22 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  40.4 
 
 
292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  41.96 
 
 
305 aa  200  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  45.09 
 
 
288 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  43.57 
 
 
294 aa  199  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  40.22 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  43.38 
 
 
309 aa  196  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 
287 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  37.24 
 
 
287 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  44.63 
 
 
305 aa  192  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  44.63 
 
 
305 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  37.63 
 
 
288 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  40.27 
 
 
292 aa  189  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  39.65 
 
 
289 aa  185  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  36.86 
 
 
292 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  51.15 
 
 
236 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  36.86 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  36.86 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
291 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
291 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
291 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 
287 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 
282 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
283 aa  139  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  33.66 
 
 
346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  31.31 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  31.31 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  31.31 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  33.81 
 
 
284 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  32.36 
 
 
351 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 
309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  30.85 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  27.67 
 
 
311 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>