More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6061 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
301 aa  592  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  86.29 
 
 
301 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  67.22 
 
 
309 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  67.79 
 
 
305 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  68.12 
 
 
305 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  55.56 
 
 
301 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  54.36 
 
 
297 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  53 
 
 
301 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  52.35 
 
 
302 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  51.68 
 
 
301 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  45.67 
 
 
301 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  49.33 
 
 
298 aa  236  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  41.81 
 
 
290 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  41.08 
 
 
313 aa  229  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  41.47 
 
 
290 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  45.95 
 
 
299 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  45.42 
 
 
316 aa  222  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  45.76 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  45.42 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  45.42 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  43.77 
 
 
293 aa  219  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  47.49 
 
 
299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  44.82 
 
 
309 aa  218  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  46.33 
 
 
292 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  44.07 
 
 
298 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  47.47 
 
 
295 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  44.33 
 
 
297 aa  216  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  44.93 
 
 
298 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  44.93 
 
 
298 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  46.32 
 
 
294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  44.93 
 
 
298 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  45.3 
 
 
300 aa  215  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  42.23 
 
 
296 aa  212  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  43.29 
 
 
292 aa  211  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  47.6 
 
 
295 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  45.48 
 
 
297 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  46.51 
 
 
291 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  46.42 
 
 
298 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  41.89 
 
 
323 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  44.52 
 
 
296 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  46.42 
 
 
298 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  45.27 
 
 
298 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 
292 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  46.67 
 
 
298 aa  206  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  45.2 
 
 
303 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  39.8 
 
 
312 aa  205  8e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  46.28 
 
 
308 aa  205  9e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  40.96 
 
 
294 aa  205  9e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  46.35 
 
 
291 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  42.42 
 
 
304 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  42.42 
 
 
304 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  42.42 
 
 
304 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  44.15 
 
 
291 aa  203  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  45.27 
 
 
304 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  46.84 
 
 
294 aa  202  7e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  43.93 
 
 
308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  43.93 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 
303 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  38.76 
 
 
317 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  45.54 
 
 
294 aa  193  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  46.03 
 
 
294 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  41.58 
 
 
321 aa  189  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  44.29 
 
 
290 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3595  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  40.97 
 
 
288 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  42.96 
 
 
292 aa  181  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  43.51 
 
 
286 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  41.89 
 
 
300 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  39.67 
 
 
336 aa  178  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  45 
 
 
288 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  42.47 
 
 
292 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  39.72 
 
 
292 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  45.18 
 
 
194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  43.22 
 
 
278 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  39.66 
 
 
292 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 
287 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  38.93 
 
 
287 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  41.01 
 
 
292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  39.32 
 
 
292 aa  165  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
289 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  38.26 
 
 
305 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  48.3 
 
 
236 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 
291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  33.95 
 
 
287 aa  136  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  35.79 
 
 
291 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  35.79 
 
 
291 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.53 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  35.06 
 
 
291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 
282 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  32.65 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 
283 aa  106  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
306 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  29 
 
 
317 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
291 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 
306 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 
306 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 
351 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  29.93 
 
 
300 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 
296 aa  96.3  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>