More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1021 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
286 aa  573  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  75.52 
 
 
288 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  66.67 
 
 
294 aa  338  5e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  65.26 
 
 
288 aa  322  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  54.04 
 
 
287 aa  318  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  54.9 
 
 
287 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  49.28 
 
 
297 aa  238  6.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  46.1 
 
 
298 aa  237  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  42.47 
 
 
292 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  45.21 
 
 
295 aa  227  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  41.84 
 
 
294 aa  226  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  42.52 
 
 
301 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  41.36 
 
 
299 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  39.59 
 
 
290 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  39.59 
 
 
290 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  43.54 
 
 
291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  42.33 
 
 
301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  43.34 
 
 
291 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  42.47 
 
 
292 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  43.39 
 
 
300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  41.89 
 
 
302 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  44.07 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  41.81 
 
 
297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  43.05 
 
 
297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  42.52 
 
 
298 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  41.16 
 
 
296 aa  212  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  42.52 
 
 
298 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  42.52 
 
 
298 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  40.89 
 
 
296 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  40.2 
 
 
323 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  41.44 
 
 
291 aa  208  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  42.27 
 
 
316 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  40.82 
 
 
298 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  42.27 
 
 
297 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  42.27 
 
 
297 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  43.75 
 
 
308 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  38.97 
 
 
312 aa  205  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  38.75 
 
 
294 aa  204  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  44.4 
 
 
303 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  41.92 
 
 
316 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  42.76 
 
 
298 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  40.94 
 
 
301 aa  201  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  41.84 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  44.53 
 
 
308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  39.74 
 
 
301 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  41.45 
 
 
290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  42.31 
 
 
298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  44.14 
 
 
308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  40.97 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  41.89 
 
 
292 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
299 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  41.3 
 
 
300 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  40 
 
 
304 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  40 
 
 
304 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  40 
 
 
304 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  39.33 
 
 
309 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  37.42 
 
 
313 aa  192  5e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  41.91 
 
 
301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  44.77 
 
 
294 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  40.07 
 
 
293 aa  189  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 
303 aa  189  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  44.52 
 
 
301 aa  188  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  42.09 
 
 
304 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  39.19 
 
 
295 aa  186  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  40.89 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  39.53 
 
 
336 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  40.48 
 
 
289 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3595  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
311 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  39.79 
 
 
305 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 
321 aa  175  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  38.28 
 
 
294 aa  172  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  41.48 
 
 
292 aa  172  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  38.28 
 
 
292 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  39.63 
 
 
278 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  37.32 
 
 
292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 
317 aa  165  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  49.11 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  46.51 
 
 
194 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  38.44 
 
 
309 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  34.67 
 
 
287 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
292 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  39.54 
 
 
305 aa  145  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  39.54 
 
 
305 aa  145  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 
291 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 
291 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 
291 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 
291 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 
291 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
301 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0113  putative hydrolase protein  32.85 
 
 
267 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal  0.0574017 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 
290 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  31.74 
 
 
283 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
287 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  33.02 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  30.27 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  30.17 
 
 
302 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 
302 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 
335 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 
287 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>