More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2996 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 335 aa  671    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  74.45 
 
 		 348 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  72.42 
 
 		 341 aa  487  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  69.09 
 
 		 340 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  37.84 
 
 		 346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  33.43 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  40.27 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  40.27 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  37.81 
 
 		 351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  39.24 
 
 		 321 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 		 283 aa  165  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  39.08 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  39.37 
 
 		 290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  35.81 
 
 		 335 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  31.83 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  36.94 
 
 		 262 aa  159  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  35.46 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  36.4 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 		 302 aa  146  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  35.19 
 
 		 319 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  33.79 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 		 291 aa  145  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.14 
 
 		 291 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 		 302 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 		 298 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 		 311 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 297 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  35.31 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 		 291 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  34.46 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  34.26 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 298 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  31.6 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  31.41 
 
 		 302 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2119  alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 284 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8637  alpha/beta hydrolase fold protein  30.75 
 
 		 370 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  24.48 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  24.48 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  30.27 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  35.23 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  33.77 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  33.77 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  33.99 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 286 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 287 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  32.06 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 294 aa  106  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 290 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0771  alpha/beta hydrolase fold protein  30.87 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  31.65 
 
 		 330 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  34.87 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.24 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  30.12 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  32.57 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1843  alpha/beta hydrolase fold  30.46 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00347923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 291 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 291 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 		 294 aa  99  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  30.85 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  32.32 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  32.08 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  30.51 
 
 		 304 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  30.51 
 
 		 304 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 297 aa  96.7  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0851  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5733  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 		 288 aa  96.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  33.1 
 
 		 297 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  33.45 
 
 		 293 aa  95.9  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  32.05 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>