More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1548 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 287 aa  592  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  42.46 
 
 		 305 aa  226  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  35.44 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  38.7 
 
 		 287 aa  179  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2990  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  hitchhiker  0.00172435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  33.91 
 
 		 308 aa  158  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  35.44 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  34.71 
 
 		 307 aa  155  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3248  EphC  36.55 
 
 		 300 aa  155  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 308 aa  152  8e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  36.94 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  33.92 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 		 289 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  32.28 
 
 		 289 aa  148  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  32.18 
 
 		 299 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  31.94 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  29.72 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 		 349 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  34.01 
 
 		 311 aa  142  9e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  34.16 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  37.63 
 
 		 307 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  37.33 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 		 284 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  32.27 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  32.64 
 
 		 287 aa  132  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.41 
 
 		 313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  37.22 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4086  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4162  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.573182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4316  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  31.71 
 
 		 494 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  32.17 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  32.75 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 		 291 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 		 288 aa  126  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11147  epoxide hydrolase ephC  31.5 
 
 		 316 aa  125  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.21 
 
 		 293 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  34.2 
 
 		 283 aa  125  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  32.18 
 
 		 297 aa  125  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  31.01 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  31.72 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  31.72 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  31.72 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  31.72 
 
 		 349 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  31.72 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  31.72 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  31.72 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  30.03 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0191  alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 		 303 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  30.97 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 288 aa  116  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 289 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  31.52 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0714  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0301539  normal  0.0245198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 292 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.74 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  27.68 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>