More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2342 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 287 aa  570  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  72.73 
 
 		 287 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  73.4 
 
 		 289 aa  411  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  56.29 
 
 		 297 aa  328  9e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  60.22 
 
 		 291 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  58.45 
 
 		 293 aa  321  7e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  55.43 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  54.71 
 
 		 288 aa  292  5e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  55.64 
 
 		 288 aa  290  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  49.62 
 
 		 283 aa  269  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  46.48 
 
 		 304 aa  257  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  46.83 
 
 		 308 aa  248  9e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  44.17 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  46.43 
 
 		 301 aa  241  7e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  47.6 
 
 		 328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  46.57 
 
 		 288 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  41.54 
 
 		 287 aa  208  8e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  51.33 
 
 		 270 aa  205  7e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  36.65 
 
 		 289 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  36.65 
 
 		 289 aa  198  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  37.11 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  41.4 
 
 		 287 aa  192  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  40.29 
 
 		 284 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  40.85 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  40.88 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  37.91 
 
 		 308 aa  175  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  38.49 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  37.25 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  37.79 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  40.73 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  35.79 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  38.35 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  40.78 
 
 		 288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  39.15 
 
 		 289 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  37.96 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  37.46 
 
 		 303 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  38.58 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  41.31 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  35.87 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  42.38 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.69 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  35.33 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  36.74 
 
 		 283 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  39.2 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 309 aa  142  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  33.99 
 
 		 312 aa  142  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  41.36 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  36.45 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  35.16 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  36.9 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  37.19 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  33.75 
 
 		 317 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5124  alpha/beta hydrolase fold protein  39.1 
 
 		 272 aa  138  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  39.58 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  38.15 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  36.13 
 
 		 311 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  36.13 
 
 		 311 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  36.13 
 
 		 296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  36.13 
 
 		 296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  36.13 
 
 		 296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  36.13 
 
 		 296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  36.5 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  36.13 
 
 		 349 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  38.6 
 
 		 349 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6199  alpha/beta hydrolase fold protein  34.2 
 
 		 296 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82135  normal  0.298395 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2042  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 		 341 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3189  alpha/beta hydrolase  35.15 
 
 		 306 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  39.69 
 
 		 284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  39.69 
 
 		 284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  39.69 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  36.3 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  29.87 
 
 		 334 aa  128  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  34.04 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  34.67 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 		 331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 		 337 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  32.78 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  32 
 
 		 315 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  36.94 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  35.25 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  36.57 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  36.57 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0770  alpha/beta hydrolase fold  33.01 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  33.57 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 		 315 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1129  alpha/beta hydrolase fold protein  32.21 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  31.15 
 
 		 345 aa  122  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>