More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4437 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
310 aa  622  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  91.29 
 
 
310 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  62.17 
 
 
307 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  57.81 
 
 
304 aa  323  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  57.76 
 
 
307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  56.44 
 
 
308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  55.52 
 
 
349 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  56 
 
 
301 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  55.99 
 
 
308 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  52.32 
 
 
299 aa  295  9e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  52.33 
 
 
308 aa  281  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  54.27 
 
 
313 aa  279  6e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  50.48 
 
 
311 aa  275  5e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  49.83 
 
 
494 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  51.21 
 
 
308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  43.61 
 
 
311 aa  225  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5429  alpha/beta hydrolase fold  43.95 
 
 
319 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5199  alpha/beta hydrolase fold  45.72 
 
 
317 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  hitchhiker  0.000578485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4812  alpha/beta hydrolase fold  45.39 
 
 
317 aa  221  9e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4898  alpha/beta hydrolase fold  45.39 
 
 
317 aa  221  9e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451029  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13701  epoxide hydrolase ephE  44.38 
 
 
327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0688152 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1377  alpha/beta hydrolase fold  43.04 
 
 
319 aa  219  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.2117  normal  0.107315 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  41.2 
 
 
322 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  46.05 
 
 
309 aa  207  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  42.72 
 
 
298 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.681258  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0418  alpha/beta hydrolase fold  45.25 
 
 
305 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0502159  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  39.67 
 
 
310 aa  186  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  38.72 
 
 
270 aa  172  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0438  alpha/beta hydrolase fold protein  36.72 
 
 
310 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  39.93 
 
 
303 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.91 
 
 
308 aa  153  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 
291 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  37.26 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 
287 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  31.83 
 
 
287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  35.53 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 
289 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  32.1 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  43.06 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  42.12 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  42.47 
 
 
294 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  53.78 
 
 
350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  34.34 
 
 
297 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 
287 aa  116  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  42.26 
 
 
283 aa  115  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  36.69 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  49.61 
 
 
330 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  44.83 
 
 
317 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  45.22 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  34.12 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  46.34 
 
 
344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  40.13 
 
 
304 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  40.35 
 
 
311 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  49.57 
 
 
323 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
328 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  46.4 
 
 
324 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  38.54 
 
 
288 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  37.38 
 
 
291 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  37.38 
 
 
291 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 
287 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 
311 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 
291 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 
293 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 
288 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  39.74 
 
 
308 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  38.03 
 
 
288 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  35.03 
 
 
351 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
305 aa  99.4  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  33.69 
 
 
281 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  39.19 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  42.24 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  39.1 
 
 
308 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  42.74 
 
 
283 aa  96.7  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.52 
 
 
293 aa  96.7  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  32.78 
 
 
288 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  34.28 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  41.13 
 
 
282 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  35.81 
 
 
326 aa  94  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 
306 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 
306 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 
323 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  30.64 
 
 
313 aa  92.4  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  39.84 
 
 
324 aa  92.4  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  41.53 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  41.53 
 
 
291 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  39.37 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 
302 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
306 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 
288 aa  90.9  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>