More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2349 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
288 aa  577  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5124  alpha/beta hydrolase fold protein  65.56 
 
 
272 aa  335  3.9999999999999995e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6199  alpha/beta hydrolase fold protein  48.15 
 
 
296 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82135  normal  0.298395 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  46.24 
 
 
271 aa  225  6e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  46.79 
 
 
276 aa  221  8e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  46.82 
 
 
309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  40.37 
 
 
283 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  42.38 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  38.3 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  38.3 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  38.3 
 
 
349 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  39.25 
 
 
296 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  39.25 
 
 
296 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  39.25 
 
 
296 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  39.25 
 
 
296 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  41.22 
 
 
281 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 
291 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  38.11 
 
 
296 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  41.64 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  37.83 
 
 
288 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.25 
 
 
293 aa  165  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  37.12 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  38.04 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.82 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  36.74 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  34.84 
 
 
287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  35.46 
 
 
281 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4229  alpha/beta hydrolase fold  39.33 
 
 
328 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
286 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  39.34 
 
 
284 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3859  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 
278 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  39.34 
 
 
284 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  39.34 
 
 
284 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  34.07 
 
 
283 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1694  alpha/beta hydrolase fold protein  36.53 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0287329  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  36.86 
 
 
289 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 
328 aa  149  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  35.87 
 
 
287 aa  149  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  34.7 
 
 
297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  35.36 
 
 
297 aa  146  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  35.97 
 
 
288 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 
308 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  34.49 
 
 
307 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  35.87 
 
 
287 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  33.44 
 
 
301 aa  142  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
292 aa  142  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  32.65 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  35.64 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 
308 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
288 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 
287 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  30.27 
 
 
289 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  30.27 
 
 
289 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 
290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  33.83 
 
 
308 aa  135  8e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  35.89 
 
 
270 aa  132  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
306 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  35.06 
 
 
293 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  33.99 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 
287 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  30.66 
 
 
284 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
313 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 
304 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  33.7 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0982  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 
308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 
307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 
294 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  29.79 
 
 
322 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3189  alpha/beta hydrolase  30.29 
 
 
306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  31.77 
 
 
301 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 
293 aa  113  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  31.11 
 
 
308 aa  113  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
312 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  34.57 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1129  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 
303 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  26.64 
 
 
334 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
323 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 
331 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
305 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  43.15 
 
 
317 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 
341 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 
287 aa  106  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 
308 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  30.93 
 
 
311 aa  105  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0688  alpha/beta hydrolase fold protein  32.07 
 
 
309 aa  105  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 
331 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
315 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
315 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5601  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
303 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.988839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>