More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4898 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4812  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
317 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4898  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
317 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451029  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5199  alpha/beta hydrolase fold  98.74 
 
 
317 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  hitchhiker  0.000578485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1377  alpha/beta hydrolase fold  78.93 
 
 
319 aa  518  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.2117  normal  0.107315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5429  alpha/beta hydrolase fold  79.31 
 
 
319 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13701  epoxide hydrolase ephE  72.53 
 
 
327 aa  473  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0688152 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  55.81 
 
 
311 aa  348  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  54.4 
 
 
322 aa  338  7e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  52.2 
 
 
313 aa  291  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  51.27 
 
 
308 aa  290  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  47.4 
 
 
308 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  48.28 
 
 
308 aa  246  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  44.83 
 
 
308 aa  241  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  46.3 
 
 
301 aa  237  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  47.15 
 
 
307 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  46.35 
 
 
349 aa  235  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  44.05 
 
 
311 aa  235  8e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  47.35 
 
 
310 aa  233  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  45.31 
 
 
304 aa  229  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  45.39 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  45.71 
 
 
494 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  41.48 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0418  alpha/beta hydrolase fold  44.16 
 
 
305 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0502159  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  40.32 
 
 
299 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  42.09 
 
 
298 aa  200  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.681258  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  43.36 
 
 
270 aa  199  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  42.32 
 
 
309 aa  196  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  38.59 
 
 
310 aa  176  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0438  alpha/beta hydrolase fold protein  35.2 
 
 
310 aa  160  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  42.04 
 
 
308 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  34.77 
 
 
286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  35.33 
 
 
287 aa  152  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 
284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  27.12 
 
 
289 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  27.12 
 
 
289 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  38.19 
 
 
294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  38.36 
 
 
307 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
287 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
291 aa  123  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
290 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  32.57 
 
 
301 aa  116  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  32.13 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 
297 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
288 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  32.06 
 
 
323 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  32.22 
 
 
287 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 
270 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  32.67 
 
 
288 aa  103  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 
288 aa  100  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  36.72 
 
 
304 aa  99.4  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  31.46 
 
 
289 aa  99  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 
337 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
305 aa  97.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  30.96 
 
 
317 aa  97.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
312 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 
292 aa  95.9  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
291 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 
287 aa  93.2  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 
308 aa  93.2  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  30.77 
 
 
289 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 
297 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  26.15 
 
 
334 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  28.66 
 
 
326 aa  90.9  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.36 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 
294 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
287 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
309 aa  90.5  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  37.8 
 
 
308 aa  89.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0522  Alpha/beta hydrolase fold-1  35.06 
 
 
241 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 
288 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 
313 aa  89.4  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 
288 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
282 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  38.61 
 
 
323 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  29.22 
 
 
322 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
283 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 
315 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 
315 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
300 aa  86.3  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 
323 aa  85.9  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2042  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  40.31 
 
 
287 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  40.15 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  39.85 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  40.15 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  41.35 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  37.01 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  43.31 
 
 
350 aa  82.8  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>